数据集概述
本数据集围绕南美安第斯山十字花科植物Stenodraba属的分类地位展开,包含分子系统发育数据(核基因ITS、质体基因trnL-F和trnH-psbA)及生态位分析结果,验证其分类归属与进化关系,为该属恢复提供科学依据。
文件详解
- 分子系统发育文件:
- 序列数据文件:如ITS_EUDEMEAE.fas、trnL-F_EUDEMEAE.fas等(.fas格式),存储核基因和质体基因的核苷酸序列
- 系统发育树文件:如BRASSICACEAE_BI_ITS.tre、RAxML_bestTree.trnL-F.tre等(.tre格式),包含不同方法构建的系统发育树结果
- 分析参数文件:如ITS+indel_MrBayes.txt(.txt格式),记录MrBayes分析的参数设置和输入数据信息
- 数据矩阵文件:如ITS_EUDEMEAE.nex(.nex格式),存储用于系统发育分析的数据矩阵
- 生态位分析文件:
- 物种分布数据文件:STENO_species.xml(.xml格式),可能包含Stenodraba属物种的分布信息
- 补充文档与图表:
- 附录文件:Appendix1.docx、Appendix2.docx(.docx格式),提供研究方法、结果等补充信息
- 补充表格:Supplementary_TableS1.xlsx、Supplementary_TableS3.docx等(.xlsx、.docx格式),包含生态位分析、分类特征等数据表格
- 补充图表:Supplementary_FIGS2.pdf、Supplementary_FIGS5.pdf等(.pdf格式),展示生态位分析结果、系统发育树等图表
适用场景
- 植物分类学研究:用于验证Stenodraba属的分类地位及与近缘属的系统发育关系
- 分子系统学分析:支持十字花科植物核基因与质体基因联合系统发育树的构建与分析
- 生态位分化研究:分析Stenodraba属不同分支的气候生态位差异及地理分布格局
- 濒危植物保护:为Stenodraba属濒危物种的保护策略制定提供分布数据与生态位信息
- 生物地理学研究:探究南美安第斯山区植物区系的进化历史与地理分布规律