nanoCAM_Gene_Based_基因表达与增强子调控完整数据

数据集概述

本数据集包含GM12878和K562细胞系的基因相关数据,涵盖样本基础信息、GpC可及性峰位置、多向增强子统计、基因位点与表达量化整合数据及差异表达基因列表,为基因相关研究提供支持。

文件详解

  • supplementarytable1_datasets_stat.xlsx:Excel格式,包含GM12878和K562细胞系重复样本的基础信息
  • supplementarytable2_GpC_peaks.xlsx:Excel格式,包含GpC可及性峰的位置信息
  • supplementarytable3_1_GM12878_ME_stat_20k.zip:压缩文件,包含GM12878细胞系的多向增强子统计数据
  • supplementarytable3_1_K562_ME_stat_20k.zip:压缩文件,包含K562细胞系的多向增强子统计数据
  • supplementarytable4_gene_PIVOT_DF.xlsx:Excel格式,整合基因位点信息、RNA-seq表达量化(TPM值)、多向增强子比例、GpC可及性等数据
  • supplementarytable5_diffgene.xlsx:Excel格式,列出通过limma识别的差异表达基因(DEGs)

适用场景

  • 细胞生物学研究:分析GM12878和K562细胞系的基因表达与调控特征
  • 表观遗传学分析:探究GpC可及性峰与基因表达的关联
  • 增强子功能研究:研究多向增强子对基因表达的调控作用
  • 差异基因分析:识别不同细胞系间的差异表达基因及其潜在功能
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 365.21 MiB
最后更新 2025年12月23日
创建于 2025年12月23日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。