数据集概述
本数据集围绕豆娘Coenagrion scitulum快速极向扩张过程中的中性与适应性基因组特征展开,包含基因组SNP、表型、气候数据及单基因座和多基因座异常检测结果,旨在解析物种扩张中的遗传漂变与适应性进化机制,支持基因组学与进化生物学研究。
文件详解
- 基因组数据文件
- 文件名称:
SNP_dataset_Coenagrion_scitulum.vcf
- 文件格式:VCF
- 字段映射介绍:包含Coenagrion scitulum的基因组SNP数据,记录单核苷酸多态性位点的基因型信息
- 表型数据文件
- 文件名称:
Phenotype_dataset_Coenagrion_scitulum.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录Coenagrion scitulum核心种群与边缘种群的表型数据,支撑表型差异与基因组特征的关联分析
- 气候数据文件
- 文件名称:
Climate_dataset_Coenagrion_scitulum.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含研究区域的气候数据,用于分析热环境对基因组适应性进化的影响
- 单基因座异常检测文件
- 文件名称:
Single_locus_outlier_detection_LFMM_parallel.xlsx、Single_locus_outlier_detection_LFMM_thermal.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:基于LFMM方法的单基因座异常检测结果,分别对应平行进化与热环境适应场景
- 多基因座异常检测文件
- 文件名称:
Polygenic_multilocus_outlier_detection_parallel.xlsx、Polygenic_multilocus_outlier_detection_thermal.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:多基因座水平的异常检测结果,识别与极向扩张及热环境适应相关的协变SNP集合
数据来源
论文“Neutral and adaptive genomic signatures of rapid poleward range expansion”
适用场景
- 物种极向扩张进化机制研究: 解析遗传漂变与适应性进化在物种范围扩张中的作用
- 基因组适应性进化分析: 利用单基因座与多基因座异常检测结果,识别适应性选择位点
- 表型-基因型关联分析: 结合表型数据与SNP数据,探究表型差异的遗传基础
- 气候适应性基因组学研究: 关联气候数据与基因组特征,分析热环境对物种扩张的选择压力
- 进化生物学多组学整合研究: 整合基因组、表型、气候数据,开展跨组学分析