数据集概述
本数据集基于NGS技术生成，包含舞毒蛾（Lymantria dispar）和僧尼蛾（Lymantria monacha）两种近缘鳞翅目林业害虫的表达序列标签数据，两种害虫对寄生蜂Glyptapanteles liparidis的寄生响应存在差异。数据集共6个文件，涵盖注释、比对、BLAST结果、实验方案及脚本、表格和重叠群等内容。
文件详解
- Annotation.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含基因表达序列标签的注释相关文件
- Alignment pools vs single.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含混合样本与单个样本的序列比对相关文件
- NCBI nt collection BLAST.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含与NCBI核苷酸数据库比对的BLAST结果相关文件
- Protocol and Scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含实验方案及分析脚本相关文件
- Table
- 文件格式：无扩展名
- 字段映射介绍：包含数据集相关的表格文件
- Contigs.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含基因序列重叠群相关文件
数据来源
Genomic Resources Notes期刊论文“NGS based generation of expressed sequence tags for Lymantria dispar and Lymantria monacha, two closely related lepidopteran species with different responses to parasitism by Glyptapanteles liparidis”
适用场景
- 林业害虫分子生物学研究: 分析舞毒蛾与僧尼蛾的基因表达特征，探究其对寄生蜂寄生响应差异的分子机制
- 基因功能注释: 基于注释文件研究两种害虫的基因功能及表达规律
- 序列比对分析: 利用比对文件开展基因序列的相似性与差异分析
- 分子生态学研究: 结合BLAST结果探究害虫与寄生蜂的互作分子基础
- 实验方法参考: 借助实验方案及脚本文件，为类似NGS实验设计提供参考
