数据集概述
本数据集记录了利用Diversity Arrays Technology(DArT)基因分型测序平台开发尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)基因组标记的过程。数据来源于马来西亚GIFT品系和埃及Abbassa品系两个选育项目的亲本群体,包含13215个单核苷酸多态性(SNP)标记和12490个silicoDArT(显性)标记,其中超10000个SNP在任一品系中具有多态性,2985个和3087个分别为GIFT和Abbassa品系特异性多态性标记。数据集共包含1个文件。
文件详解
- 文件名称:
DRYAD-Report-DTi15-1800-recoded.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:文件为Excel格式,内容应包含尼罗罗非鱼DArT标记开发的相关数据,可能涉及标记类型(SNP/silicoDArT)、标记数量、品系特异性多态性标记信息等与基因组标记开发和遗传评估相关的字段。
数据来源
论文“Development of Diversity Arrays Technology markers as a tool for rapid genomic assessment in Nile tilapia, Oreochromis niloticus”
适用场景
- 水产养殖基因组标记开发研究:分析DArT平台在尼罗罗非鱼中开发SNP和silicoDArT标记的效率与特征。
- 罗非鱼选育项目遗传评估:利用品系特异性多态性标记,开展GIFT和Abbassa品系的遗传多样性、群体结构及亲缘关系分析。
- 分子标记辅助育种应用:评估DArT标记在罗非鱼快速基因组筛选和育种方案中的潜在应用价值。
- 水产动物基因组学研究:为尼罗罗非鱼及其他水产养殖物种的基因组标记开发提供技术参考和数据支持。