数据集概述
本数据集通过系统生物学方法研究拟南芥对木质素生物合成扰动的响应，分析了20个木质素生物合成途径单基因突变体的花序茎转录组和代谢组数据，包含566种检测化合物及差异表达基因信息，揭示木质素扰动后的代谢网络变化。
文件详解
- 文件名称：
microarraydata_vanholme_etal_2012_tpc102574.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含拟南芥木质素生物合成突变体的转录组和代谢组数据，具体涵盖20个突变体（涉及PAL1、PAL2、C4H等10个基因的两种等位突变）的基因表达量、566种检测化合物的代谢物丰度，以及差异表达基因与代谢物的关联信息。
数据来源
论文“A systems biology view of responses to lignin biosynthesis perturbations in Arabidopsis”
适用场景
- 植物代谢网络研究：分析木质素生物合成扰动对拟南芥代谢通路的系统性影响
- 木质素工程优化：为木质纤维素生物质改良的基因编辑策略提供代谢响应数据支持
- 转录组与代谢组关联分析：通过多组学数据整合揭示基因表达与代谢物积累的调控关系
- 植物酚类代谢机制研究：识别参与酚类化合物代谢的新基因及调控路径
