数据集概述
本数据集包含海胆胚胎多能祖细胞（CPCs）规范网络的关键调控数据，聚焦Notch和Nodal信号对叉头因子foxY表达的控制机制。数据涵盖基因信息、扰动实验的原始数据及定量分析结果，涉及Cyclopamine处理的不同时间点，用于解析CPCs命运决定的调控层级。
文件详解
- 代码集信息文件
- 文件名称：CODESET-INFORMATION.txt、CODESET-INFORMATION.xlsx
- 文件格式：TXT、XLSX
- 字段映射介绍：包含基因名称（Name）、登录号（Accession No.）、探针序列（Probe Sequence）等基因信息，如ActivinB的EU526314.1登录号及对应探针序列。
- 扰动实验数据文件
- 文件名称：PERTURBATION-DATA.txt、PERTURBATION-DATA.xlsx
- 文件格式：TXT、XLSX
- 字段映射介绍：记录Cyclopamine处理（22h-38h、22h-48h两个时间点）的扰动实验原始数据及定量分析结果，涉及海胆胚胎CPCs相关转录因子表达变化。
- 存档与说明文件
- 文件名称：Archive.zip、README_for_Archive.txt
- 文件格式：ZIP、TXT
- 字段映射介绍：Archive.zip为数据压缩包；README_for_Archive.txt说明数据集包含基因信息、扰动实验原始数据及定量分析结果，列出Cyclopamine处理的时间点及实验背景。
数据来源
论文“Notch and Nodal control expression of a forkhead factor in the specification network of a multipotent progenitor population in sea urchin”
适用场景
- 发育生物学调控网络研究: 分析Notch、Nodal信号对海胆胚胎多能祖细胞foxY表达的调控机制，解析CPCs命运决定的转录层级。
- 胚胎细胞分化机制分析: 探究多能祖细胞维持发育潜能的分子基础，以及信号通路对细胞命运的调控作用。
- 扰动实验数据分析: 利用Cyclopamine处理的时间点数据，研究Hedgehog信号对海胆胚胎发育的影响。
- 基因表达调控研究: 通过代码集信息中的探针序列，开展海胆胚胎特定基因的表达定量与验证实验。
