数据集概述
本数据集围绕历史乙醇保存博物馆标本的序列捕获系统发育基因组学研究展开，包含35份新鲜标本与15份历史乙醇保存标本（蛛形纲盲蛛目）的超保守元件（UCEs）测序数据，验证了该类标本在现代基因组学研究中的应用价值，涉及基因位点提取、系统发育分析等相关结果文件。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre格式）
- 文件名称：65:65_CORE_50PercentTaxon_RAxML_bipartitions.result.tre、82:80_CORE_50PercentTaxon_RAxML_bipartitions.result.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：记录基于不同样本集（65样本、80样本）构建的系统发育树结果，包含分支支持度等系统发育分析信息
- UCE基因位点压缩文件（.zip格式）
- 文件名称：65:65_CORE_50PercentTaxon_UCEloci.zip、82:80_CORE_50PercentTaxon_UCEloci.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩存储对应样本集的超保守元件（UCEs）基因位点数据
- 系统发育矩阵文件（.phylip格式）
- 文件名称：65:65_CORE_50PercentTaxon.phylip、82:80_CORE_50PercentTaxon.phylip
- 文件格式：PHYLIP
- 字段映射介绍：记录不同样本集的系统发育分析矩阵数据，用于构建系统发育树
数据来源
论文“Sequence capture phylogenomics of historical ethanol-preserved museum specimens: unlocking the rest of the vault”
适用场景
- 博物馆标本基因组学研究: 验证历史乙醇保存标本在序列捕获系统发育基因组学中的应用可行性
- 生物多样性系统发育分析: 利用UCE基因位点数据构建蛛形纲盲蛛目物种的系统发育关系
- 降解DNA测序技术优化: 分析针对历史乙醇保存标本的降解DNA提取与序列捕获技术效果
- 生物标本资源遗传价值挖掘: 为全球博物馆乙醇保存标本的遗传数据获取提供方法参考
