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标签: 超保守元件

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  • Cheliceroides_基于分子形态数据的跳蛛属分类修订数据

    2026年2月13日 30 164 83

    数据集概述 本数据集为跳蛛属Cheliceroides分类修订研究数据,包含基于超保守元件(UCE)和线粒体基因组蛋白编码基因的分子序列数据,以及形态学证据相关文件,用于验证该属的分类地位,共8个文件。 文件详解 README.md:MD格式,数据集说明文档,介绍数据内容与文件结构...
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  • UCE_Based甲虫超保守元件探针集设计比较研究数据

    2026年1月30日 30 202 188

    数据集概述 本数据集为论文“To design, or not to design? Comparison of beetle ultraconserved element probe set utility based on phylogenetic distance, breadth, and method of probe...
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  • UCE_Based_超保守元件目标捕获与测序比较研究数据

    2026年1月30日 30 112 71

    数据集概述 本数据集为超保守元件(UCEs)目标捕获与大规模平行测序研究相关数据,包含五种新热带雨林鸟类的UCE基因座数据,涉及物种树构建、溯祖模型分析及物种界定等研究内容,共8个文件,支持浅进化时间尺度下的遗传比较分析。 文件详解 压缩文件(archive_files)...
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  • UCE_Based_大基因组蝾螈超保守元件测序与进化分析数据

    2026年1月29日 30 4 2

    数据集概述 本数据集为针对大基因组蝾螈(Plethodon serratus)超保守元件(UCEs)的序列捕获与下一代测序数据,包含85个样本的6亿余条测序读段分析结果,用于解析种内系统地理关系与隐存种界定,验证UCEs协议在大基因组生物研究中的适用性。 文件详解 压缩文件(.zip)...
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  • UCE_Based_新热带界雨林鸟类超保守元件基因测序研究数据

    2026年1月29日 30 32 2

    数据集概述 本数据集为浅进化时间尺度比较研究的超保守元件(UCEs)目标捕获与大规模平行测序数据,包含5种新热带界雨林鸟类的776-1516个UCE位点,53-77%位点具多态性,平均每个多态位点含2.0-3.2个可变位点,可用于物种树构建、溯祖建模及物种界定等分析。 文件详解 主数据压缩包 文件名称:full.zip 文件格式:ZIP...
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  • Hypocnemis_Based亚马逊蚁鸟分化UCEs遗传学数据集

    2026年1月27日 30 94 75

    数据集概述 本数据集包含从亚马逊蚁鸟Hypocnemis(隶属蚁鸟科)58个标本中提取的超保守元件(UCEs)和外显子序列处理文件,涵盖所有已知物种及除一个亚种外的样本。数据集分为8个子集,用于系统发育、种群结构、种间界限及生物地理历史的推断,支持不同遗传标记和分析方法的研究。 文件详解...
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  • Synbranchiformes_Based全球扩散生物地理学研究数据

    2026年1月26日 30 38 12

    数据集概述 本数据集包含合鳃鱼目(Synbranchiformes)鱼类的超保守元件(UCEs)测序数据及系统发育分析结果,用于研究该类群的全球扩散历史与生物地理学模式。数据支持东南亚为主要类群祖先区域的结论,排除冈瓦纳大陆分裂假说,揭示独立大陆入侵事件,共包含十五个文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre)...
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  • Habronattus_Salticidae_Based跳蛛物种复合体渐渗杂交进化影响研究数据

    2026年1月11日 30 95 40

    数据集概述 本数据集聚焦跳蛛Habronattus americanus物种复合体,探究渐渗杂交对其进化的影响。通过RADseq、超保守元件(UCEs)及形态学数据,分析基因组与形态的进化模式,揭示快速辐射与频繁渐渗导致的网状进化历史,包含267个文件,以基因序列数据为主。 文件详解 基因序列文件...
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  • Phrynosoma_Based_角蜥属系统基因组学靶向序列捕获研究数据

    2026年1月21日 30 92 62

    数据集概述 本数据集为角蜥属(Phrynosoma)系统基因组学研究的靶向序列捕获数据,包含540个超保守元件和44个蛋白编码基因的序列信息,用于解析17种角蜥的系统发育关系,解决此前分子系统发育分析中的冲突,支持四大亚群的分类框架,为比较分析提供基础。 文件详解 文件名称:Loci.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...
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  • Ant_Agriculture_Based_蚂蚁农业进化与真菌驯化研究数据

    2026年1月21日 30 103 95

    数据集概述 本数据集围绕蚂蚁农业进化研究展开,包含支持“走出雨林”假说及真菌驯化环境分析的相关数据。通过基因组学数据重建真菌种植蚂蚁的进化史,探究农业系统、栖息地偏好与生物地理的演化历程,共包含八个文件,以压缩包为主。 文件详解 生物地理与性状多样化文件(biogeo-trait-diversification-files.zip) 文件格式:ZIP...
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  • BearUCE_Based_北极熊棕熊黑熊基因组分子系统发育与SNP变异数据

    2026年1月20日 30 182 48

    数据集概述 本数据集基于基因组测序数据,分析北极熊、棕熊和黑熊的分子系统发育关系及SNP变异,平均测序覆盖度25X,鉴定出1380万个SNP,通过UCE序列分析构建系统发育树,还包含336只熊的162个SNP位点基因型数据,共2个文件。 文件详解 BearUCE_with_PartitionsRob.nex 文件格式:NEX...
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  • Epinecrophylla_Based_新热带区枯叶觅食蚁鹩系统发育研究数据

    2026年1月19日 30 52 22

    数据集概述 本数据集为新热带区枯叶觅食蚁鹩(Epinecrophylla属)的系统发育研究数据,基于超保守元件(UCEs)大规模平行测序,包含该属8个物种的亚种级系统发育树、种群遗传分析及修订分类相关的原始与处理数据,共8个文件,支持鸟类分类学与生物地理学研究。 文件详解 核心分析文件 文件名称:UCE_gene_trees-RAxML.tre...
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  • Dryad_Myrmelachista_Based蚁_植物共生趋同演化研究数据

    2026年1月19日 30 5 3

    数据集概述 本数据集为蚁-植物共生系统趋同演化研究相关数据,包含Myrmelachista属蚂蚁的超保守元件(UCE)基因组学数据、祖先状态重建文件、系统发育树文件等。研究通过分子系统发育分析揭示该属蚂蚁从机会主义到专性共生的独立演化事件,支持趋同演化假说,共包含七个文件。 文件详解 说明文档 文件名称:README.md 文件格式:MD...
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  • Accipiter_Hawks_Based加勒比岛屿特有鹰类进化与保护研究数据

    2026年1月19日 30 206 32

    数据集概述 本数据集聚焦加勒比岛屿特有Accipiter鹰类的系统进化与保护研究,包含38个样本的超保守元件(UCEs)、线粒体基因组序列及单核苷酸多态性(SNPs)相关分析文件,用于探究加勒比种群与大陆种群的亲缘关系、遗传分化及物种界定,支持该类群的保护评估。 文件详解 序列与比对文件 文件名称:Catanachetal2021_UCE.fasta...
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  • Dryad_Leptonetid蜘蛛系统基因组学与生物地理学研究数据集2021

    2026年1月19日 30 78 16

    数据集概述 本数据集为Leptonetid科蜘蛛的系统基因组学与生物地理学研究数据,包含基于超保守元件(UCEs)构建的“宽松”和“严格”两种数据矩阵,以及系统发育分析、分子定年、生物地理推断等相关结果文件,共11个文件,支持该科蜘蛛的分类修订、演化历史及分布格局研究。 文件详解 文档类文件 文件名称:READMELedfordetal2021.txt...
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  • Arachnida_UCE_Based_蛛形纲超保守元件探针集系统发育分析数据

    2026年1月19日 30 160 94

    数据集概述 本数据集包含用于蛛形纲系统发育研究的超保守元件(UCEs)探针集相关数据,涵盖32种不同蛛形纲物种的目标测序结果,平均获取487个UCE位点,可支持系统发育分析、物种界定及多样性研究,共包含2个压缩文件。 文件详解 Trinity_assemblies.zip 文件格式:ZIP...
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  • Syngnathiformes_Based_海龙目鱼类超保守元件系统基因组学分析数据

    2026年1月18日 30 130 110

    数据集概述 本数据集为海龙目鱼类系统基因组学研究数据,基于超保守元件(UCEs)分析海龙目鱼类的快速辐射进化关系。包含序列比对、组装文件、系统发育树、分析输出等7个文件,支持解析海龙目鱼类主要类群的系统发育关系,验证传统长吻类群单系性及基部快速辐射假说。 文件详解 AccessionInfo.txt 文件格式:TXT...
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  • Hemiptera_UCE_Based_半翅目系统发育研究诱饵集与基因组资源整合数据

    2026年1月18日 30 189 14

    数据集概述 本数据集基于为半翅目系统发育设计的超保守元件(UCE)诱饵集,包含36个半翅目样本(覆盖3个亚目、7个异翅亚目下目、23科、34属)及1个缨翅目外群的UCE数据,同时整合了已发表基因组/转录组的UCE位点挖掘结果,可支持系统发育、种群遗传及分子进化研究。 文件详解 RAxML_alignInput_&_Trees.zip...
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  • Suwallia_Phylogenomics_石蝇属系统发育基因组学研究数据2020

    2026年1月18日 30 18 15

    数据集概述 本数据集为石蝇属Suwallia(襀翅目:绿襀科)的系统发育基因组学研究数据,基于全基因组超保守元件(UCE)位点的DNA序列数据构建该属首个分子系统发育树,评估其单系性,揭示分类学问题及生物地理历史,包含1个压缩文件。 文件详解 文件名称:suwalliaphylogenomics2020-main.zip 文件格式:ZIP...
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  • Cephalotes_Based_新热带区蚂蚁系统发育与地理分布进化研究数据2022

    2026年1月18日 30 37 3

    数据集概述 本数据集整合超保守元件(UCEs)、化石及生物地理分布数据,探究新热带区多样性龟蚁属(Cephalotes)的系统发育与地理分布进化,分析巴拿马地峡隆起及GAARlandia陆桥对该类群进化的影响,提供龟蚁属系统发育框架及地理分布演变的关键数据支撑。 文件详解 README_PRICE_ETAL_2022_DATA.txt 文件格式:TXT...
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