数据集概述
本数据集来自Papadopoulou & Knowles（2015）的研究，聚焦地中海Pleistocene Aggregate Island Complex（PAIC）系统中13种无翅拟步甲对岛屿连通性循环的物种特异性响应，通过隔离阻力分析、层次AMOVA、系统发育排序等方法，探究水深、栖息地稳定性等因素对种群分化的影响，并利用贝叶斯计算验证系统发育地理一致性预测模型，共包含7个文件。
文件详解
- 说明文件（README）
- 文件名称：README_for_SequenceAlignments.txt、README_for_TreeFiles.txt、README_for_MantelTestInputFiles.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：分别对应序列比对、基因树文件、Mantel检验输入文件的说明文档，包含数据来源、分析方法、参数设置等背景信息（如TreeFiles的README提及Cox1基因树的BEAST分析参数：对数正态不相关松弛时钟、平均速率0.0168替换/位点/百万年、4次独立运行各2000万代等）。
- 压缩文件（Archive）
- 文件名称：SequenceAlignments.zip、TreeFiles.zip、MantelTestInputFiles.zip、hABC_dppmsbayes_InputFiles.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：分别包含序列比对数据、基因树文件、Mantel检验输入数据、层次近似贝叶斯计算（hABC-dppmsbayes）的输入文件，为研究提供核心分析素材。
数据来源
论文“Species-specific responses to island connectivity cycles: refined models for testing phylogeographic concordance across a Mediterranean Pleistocene Aggregate Island complex”
适用场景
- 岛屿生物地理学研究: 分析地中海PAIC系统中岛屿连通性循环对物种分化的驱动作用。
- 系统发育地理一致性验证: 利用贝叶斯计算模型检验不同物种在PAIC群岛的系统发育地理模式一致性。
- 种群分化影响因素分析: 通过隔离阻力分析探究水深、栖息地稳定性、岛屿大小、体型等因素对种群遗传分化的作用。
- 进化生物学模型优化: 对比传统一致性零假设与纳入地理及生态性状的精细化模型，优化物种分化驱动机制的解释框架。
- 生物多样性保护研究: 为地中海岛屿特有物种的保护策略制定提供系统发育地理层面的科学依据。
