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Dryad_Based_南非Memecylon属植物网状进化研究数据
2026年1月25日 30 137 79
数据集概述 本数据集为南非Memecylon属植物进化研究相关数据,包含基因树、物种树、序列比对、分区文件等多种类型文件,用于探究该属植物类群的系统发育关系、基因流及网状进化证据,支持植物分类学与进化生物学研究。 文件详解 Dryad_ReadMe.docx 文件格式:DOCX 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、使用方法等信息...
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Psoralea_Based_豆科Psoralea属分类学研究数据集
2026年1月25日 30 46 22
数据集概述 本数据集是豆科Psoralea属分类学研究的配套文件,包含系统发育分析相关的样本信息、数据处理结果及进化树文件。数据支撑Psoralea属的分类修订研究,涵盖样本ENA登录号、缺失数据与旁系同源基因统计、位点共识序列、比对序列、基因树及物种树等内容,共7个文件。 文件详解 1_Appendix...
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turtle_genomic_Based龟类进化多样化基因组研究数据
2026年1月25日 30 94 19
数据集概述 本数据集为龟类进化多样化的基因组研究数据,包含19个代表性龟类基因组的单拷贝直系同源基因、26个龟类物种的二代测序标记,以及系统发育分析结果。数据用于探究龟类进化中的系统发育异质性、基因树-物种树冲突等问题,共17个文件,涵盖对齐序列、基因树、物种树、日志及补充表格等内容。 文件详解 压缩包文件(.zip/.tar.gz)...
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DeGiorgioDegnan_Based_物种树推断稳健性研究数据
2026年1月23日 30 180 168
数据集概述 本数据集围绕物种树推断的稳健性展开,对比MP-EST、STAR、STEAC、STELLS和STEM等方法在处理最大似然与贝叶斯基因树时的表现,分析分歧时间低估对推断准确性的影响,包含1个压缩文件,用于系统发育方法的性能评估与误差机制研究。 文件详解 文件名称:DeGiorgioDegnanRobustness.zip 文件格式:ZIP...
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Sarracenia_Based_北美食肉植物属系统发育关系研究数据
2026年1月23日 30 82 12
数据集概述 本数据集为研究北美食肉植物Sarracenia属系统发育关系的目标捕获法分析结果,包含75个样本的199个核基因序列及叶绿体基因组序列,用于解析该年轻分支(<300万年)的进化关系、生物地理起源及基因树异质性,共8个文件。 文件详解 基因树文件...
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Heuchera_Based_植物系统发育研究内含子序列标记富集方法数据
2026年1月21日 30 207 135
数据集概述 本数据集来自Heuchera属(虎耳草科)系统发育研究,包含针对近期辐射类群设计的内含子序列标记富集方法相关数据,涉及核基因、叶绿体、线粒体基因组的序列矩阵与系统发育树,支持植物系统发育关系分析与标记方法验证。 文件详解 系统发育树文件(.tre格式,共5个)...
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Tuatara_Genome_Based_大蜥蜴视觉系统分子进化支持数据集
2026年1月21日 30 78 21
数据集概述 本数据集为《大蜥蜴基因组:来自古老爬行纲唯一现存物种的脊椎动物进化洞察》论文的补充数据,聚焦大蜥蜴视觉系统的分子进化研究。包含基因树、补充文件、PAML结果表和基因序列比对等四类文件,总计4个文件,用于支持相关进化分析。 文件详解 Schott Tuatara Vision Gene Trees.zip 文件格式:ZIP...
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Gesneriaceae_Based_核基因靶向捕获_系统基因组学研究数据
2026年1月21日 30 7 3
数据集概述 本数据集为苦苣苔科(Gesneriaceae)核基因靶向捕获的系统基因组学研究数据,包含针对该科设计的830个单拷贝基因捕获探针、参考序列、系统发育树及补充表格等7个文件,用于解析苦苣苔科的系统发育关系,支持不同分类水平的进化研究。 文件详解 描述文件 文件名称:DESCRIPTION.txt 文件格式:TXT...
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Aphelocoma_SpeciesTree_鸦属物种分化时间校准与模拟数据
2026年1月20日 30 4 2
数据集概述 本数据集围绕Aphelocoma鸦属物种分化时间校准展开,对比物种树与基因树在分化时间估算中的差异,探讨物种形成与地质事件的关联。包含物种树校准文件与模拟代码,为研究物种分化历史提供数据支持。 文件详解 文件名称:SpeciesTreeAphelocomawithinstructions.xml 文件格式:XML...
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Sulawesi_Based_苏拉威西特有松鼠进化史研究数据_博物馆标本测序
2026年1月20日 30 156 111
数据集概述 本数据集为基于博物馆标本测序的苏拉威西特有松鼠进化史研究数据,包含全线粒体基因组和核超保守元件(UCEs)数据,用于构建系统发育树,探究其适应辐射历史、类群分化时间及核质基因树冲突机制,共含9个文件。 文件详解 信息统计文件 文件名称:FcC_info.xls 文件格式:XLS 字段映射介绍:推测包含测序样本信息、基因位点统计等基础数据...
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Dioscorea_Based_薯蓣属核基因靶标富集系统发育基因组基线研究数据
2026年1月20日 30 119 15
数据集概述 本数据集为薯蓣属(Dioscorea)系统发育基因组研究定制的核基因靶标富集面板相关数据,包含260个低拷贝至单拷贝核基因的诱饵序列、靶标基因特征、基因分区方案、序列长度、统计摘要、基因树、序列比对及与现有被子植物面板的比较文件,可支持薯蓣属系统发育关系解析及栽培种起源研究。 文件详解...
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Molecular_Pleuronectiformes_单系性分子证据研究数据
2026年1月20日 30 147 93
数据集概述 本数据集为支持鲽形目(Pleuronectiformes)单系性的分子证据研究数据,包含基因树、补充表格及组合数据集等文件。针对该类群进化关系的争议,通过重新分析现有数据并结合新数据,明确支持其单系性,反驳了不对称体型独立起源的观点,为解决系统发育难题提供数据支撑。 文件详解 文件名称:GENE_TREES_STAR_SP_TREE.tre...
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Phylogenetic_Data_系统发育信号分析_串联比对与基因树研究数据
2026年1月19日 30 141 69
数据集概述 本数据集围绕原核生物与真核生物的串联比对及基因树展开分析,包含原核生物3个分类深度(γ变形菌、变形菌、原核生物)的248个基因树(315个基因组),以及真核生物2个分类深度(动植物真菌跨类群、真菌内部)的279个基因树(85个基因组),用于探究系统发育树不一致的来源及单基因与串联比对的重叠程度。 文件详解...
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Metatranscriptomics_Based_鸟类血液寄生虫宏转录组研究数据
2026年1月18日 30 208 59
数据集概述 本数据集基于北美鸣禽24份血液样本的宏转录组测序,针对低强度、多物种感染的血液寄生虫(血孢子虫)开展研究。通过分离宿主与寄生虫转录本并分配至血孢子虫属,提供33个系统发育多样化的血孢子虫线粒体谱系的1,502个单拷贝直系同源基因座数据,可支持寄生虫进化与感染检测研究。 文件详解 文档类文件...
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Dryad_Andean_Freziera属系统基因组数据集_v9s4mw72k
2026年1月15日 30 125 69
数据集概述 本数据集为安第斯山脉云雾林特有植物Freziera属(五列木科)的首个系统基因组研究数据,基于50个物种(约占总物种数的三分之二)的标本馆样本,通过Angiosperms353通用基因座的杂交富集靶向测序捕获获得。数据揭示了该属系统基因组复杂性,包括大量旁系同源基因座和基因树冲突,为解析其演化历史提供基础。 文件详解 README.md...
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Ischyropsalidoidea_Based_节肢动物超科系统发育基因组学分析数据
2026年1月14日 30 56 8
数据集概述 本数据集是针对盲蛛超科Ischyropsalidoidea系统发育关系的基因组学分析成果,包含10个相关文件。通过整合转录组与桑格测序数据,采用多种系统发育分析方法(如串联法、溯祖法等),解决了该类群早期分化的系统发育问题,为节肢动物分类与演化研究提供了数据支持。 文件详解 基因树文件...
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Myzostomid_Transcriptome_Based_基因家族系统发育分析数据
2026年1月14日 30 190 100
数据集概述 本数据集为Myzostomid转录组基因家族系统发育分析数据,基于Illumina转录组序列与29种参考后生动物蛋白序列聚类的基因家族构建,包含989个序列家族联配的超级联配数据集及1878个基因树,用于探究Myzostomida在动物生命树中的系统发育位置,支持最大似然法和基因树简约法分析。 文件详解 文件名称:geneTrees.zip...
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Magalhaes_et_al_Sicarius_cariri_蜘蛛遗传与地理信息数据
2026年1月13日 30 64 27
数据集概述 本数据集包含巴西卡廷加干旱林特有蜘蛛Sicarius cariri的遗传与地理信息,涵盖线粒体(COI)和核基因(H3)的序列比对、系统发育分析输入文件、种群遗传参数及地理分布数据,用于研究其系统发育地理结构、种群动态及物种分化历史,共24个文件。 文件详解 遗传与地理信息文件...
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Hybridization_Detection_Based_基因树额外谱系似然计算模型数据
2026年1月12日 30 164 115
数据集概述 本数据集围绕基因树与物种树不一致的检测方法展开,聚焦于在存在不完全谱系分选(ILS)的情况下,通过额外谱系数量的似然计算来检测杂交事件。提供了相关R函数、解释说明及教程,可用于模拟基因树、评估不同基因流水平模型的似然性,以识别物种间的基因流。 文件详解 README_for_supplementary.txt 文件格式:TXT...
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Themeda_Hybridisation_澳洲Triandra谱系杂交与叶绿体捕获研究数据
2026年1月12日 30 194 59
数据集概述 本数据集围绕澳洲Themeda triandra不同谱系的杂交与叶绿体捕获现象展开,支持对该物种生态型适应性、进化历史及基因交流机制的研究。包含全基因组测序数据、细胞器基因组数据及系统进化分析结果,涉及核DNA、核糖体DNA、线粒体DNA和叶绿体DNA四类遗传物质的序列与树文件。 文件详解 README 文件格式:无扩展名...



