数据集 - 海数据

热带气候下基因组复制的重复迁移研究数据

2026年2月9日 30 15 8

数据集概述本数据集为论文“Repeated shifts out of tropical climates preceded by whole genome duplication”的配套分析数据，包含研究所需的输入数据、输出结果及分析脚本，共6个文件，涵盖转录组、叶绿体、生物气候与生活史数据库等内容，支持植物进化相关分析。文件详解...

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Viola_Based多倍体物种网络定年分析数据

2026年2月9日 30 22 14

数据集概述本数据集为被子植物Viola属（Violaceae）的多倍体物种网络定年分析数据，包含从基因树到多倍体网络构建的相关文件。涉及42个代表16个组的物种的DNA序列、化石校准的时间树、多标记基因组树及对应网络，用于评估多倍体物种的系统发育关系及定年分析，共24个文件。文件详解基因树与时间树文件（.trees格式，12个）...

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Zosterops_Based_白眼圈雀系统基因组学研究数据

2026年2月9日 30 78 40

数据集概述本数据集是关于白眼圈雀属（Zosterops）的系统基因组学研究数据，白眼圈雀被称为“伟大的物种形成者”。研究通过对历史标本和近期采集样本的广泛地理DNA采样，使用700多个全基因组位点、 coalescent物种树方法和基因流检测方法，揭示了其网状进化历史，确定印度尼西亚群岛特别是婆罗洲为谱系多样性中心。数据集包含8个文件。文件详解...

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Eco_genetic_野生小麦异源多倍体生态遗传加性研究数据

2026年2月8日 30 45 12

数据集概述本数据集围绕异源多倍体野生小麦的生态遗传加性展开研究，验证四倍体祖先二倍体遗传与生态特征的加性效应，分析生态约束对物种分布的影响。包含遗传变异、气候生态位建模等相关数据与代码，共10个文件。文件详解代码文件（.r格式，共5个）...

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真菌基因转移数据的基因组规模系统发育分析

2026年2月2日 30 57 47

数据集概述本数据集为真菌基因组规模系统发育分析相关数据，包含基因家族选择、序列比对结果、基因树与物种树整合计算输出等内容，用于探究基因转移在真菌进化中的作用，支持比较基因组进化动力学研究，共含六个文件。文件详解 README_for_TreeAConcatenate.txt 文件格式：TXT...

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整合鸟类虱子寄生虫的系统发育与群体遗传学进化数据

2026年2月1日 30 28 5

数据集概述本数据集整合了寄生在新大陆地鸠身上的体虱全基因组序列的系统发育和种群遗传数据，用于分析寄生虫多样性的形成过程（如协同物种形成、宿主转换）。通过比较虱子与地鸠的系统发育关系，揭示了长期进化尺度下的系统发育一致性及宿主特异性，同时发现部分广食性虱子类群在种群水平上的生物地理结构。文件详解系统发育树文件（.tre、.tree、.trees）...

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Sclerobunus属综合分类学与物种界定数据

2026年2月1日 30 100 26

数据集概述本数据集围绕北美西部山区Sclerobunus属盲蛛的综合分类与物种界定展开，通过形态学分析与遗传学验证结合的方法，完成属级分类修订，包括属的合并、亚种升级及新物种描述，为该类群的物种多样性研究提供数据支持。文件详解 Sclerobunus_SpeciesTree_Derkarabetian&Hedin2014.tre...

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ASTRAL_Source_基因组规模物种树估计数据集

2026年1月31日 30 119 18

数据集概述本数据集为ASTRAL方法（一种基于多物种溯祖模型的基因组规模物种树估计方法）相关的研究数据，包含模拟与生物学数据集，用于支持物种树估计的准确性验证与方法比较，共6个文件，涵盖说明文档、真实树、模拟脚本、序列数据、估计基因树及生物学数据等类型。文件详解文件名称：README.md 文件格式：MD...

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SimPhy_Based_物种树推断方法模拟配置脚本数据

2026年1月30日 30 183 166

数据集概述本数据集包含用于系统发育模拟研究的SimPhy配置脚本压缩包，支持探究物种树推断方法在存在旁系同源（paralogy）和/或不完全谱系分选（ILS）情况下的鲁棒性。研究通过模拟及生物数据集分析，验证ILS感知方法处理旁系同源数据的准确性，扩展可用分析位点数量。文件详解文件名称：simphy-configuration-files.zip...

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DRYAD_Based_C4光合作用新基因平行进化研究数据

2026年1月30日 30 177 159

数据集概述本数据集包含C4光合作用新基因平行进化研究的相关文件，涉及两种C4光合作用起源中基因复制的独立平行进化机制，重点分析维管束鞘细胞优先表达基因及SWEET-13转运蛋白的功能，为C4植物韧皮部装载机制提供新见解。文件详解 README_for_Trees.txt 文件格式：TXT...

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Memecylon_Based_植物演化与生物地理学研究数据集

2026年1月29日 30 102 59

数据集概述本数据集围绕Memecylon属（野牡丹科）的演化与生物地理学研究展开，包含通过目标捕获技术获取的67个Memecylon类群的基因组数据，支持系统发育分析、分化时间估算、生物地理历史重建及形态特征演化研究，共7个相关文件。文件详解 README.docx 文件格式：DOCX...

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PAIC_Based_地中海群岛物种响应岛屿连通性循环研究数据

2026年1月28日 30 28 5

数据集概述本数据集来自Papadopoulou & Knowles（2015）的研究，聚焦地中海Pleistocene Aggregate Island...

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GPWG_III_Based_禾本科系统发育分析全流程数据仓库

2026年1月28日 30 92 39

数据集概述本数据集是禾本科系统发育研究工作组III（GPWG III）的数据仓库，包含基于核基因（Angiosperm353基因集）和质体数据的禾本科系统发育分析数据，涉及1153个样本（对应1133个接受种）。数据涵盖元数据、核基因分析结果、基因树-物种树...

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代谢组学引导的基因组比较研究_哺乳动物冬眠基因趋同进化数据分析

2026年1月28日 30 79 6

数据集概述本数据集配套“Genes Underlying Adaptive Physiological Shifts Among Hibernating Mammals”手稿，包含基因组、系统发育及功能富集数据，用于研究哺乳动物冬眠相关性状（尤其是肉碱代谢）的进化机制，覆盖物种树、基因树、功能富集等多类型资源。文件详解系统发育资源...

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Squamata_Based_有鳞目基因组规模数据系统发育分析数据集

2026年1月26日 30 48 12

数据集概述本数据集基于289个样本的高通量测序数据，覆盖75个有鳞目科，用于分析其系统发育关系、估算分化时间及评估拓扑不确定性。重点验证传统形态学分类群（如Scleroglossa和Macrostomata）的基因组支持度，探讨基因树与物种树不一致的原因，包含23个相关文件。文件详解文档类文件文件名称：Fig_S1_Phylogenetic...

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Dryad_Based_南非Memecylon属植物网状进化研究数据

2026年1月25日 30 176 88

数据集概述本数据集为南非Memecylon属植物进化研究相关数据，包含基因树、物种树、序列比对、分区文件等多种类型文件，用于探究该属植物类群的系统发育关系、基因流及网状进化证据，支持植物分类学与进化生物学研究。文件详解 Dryad_ReadMe.docx 文件格式：DOCX 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据背景、使用方法等信息...

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Psoralea_Based_豆科Psoralea属分类学研究数据集

2026年1月25日 30 187 99

数据集概述本数据集是豆科Psoralea属分类学研究的配套文件，包含系统发育分析相关的样本信息、数据处理结果及进化树文件。数据支撑Psoralea属的分类修订研究，涵盖样本ENA登录号、缺失数据与旁系同源基因统计、位点共识序列、比对序列、基因树及物种树等内容，共7个文件。文件详解 1_Appendix...

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turtle_genomic_Based龟类进化多样化基因组研究数据

2026年1月25日 30 139 82

数据集概述本数据集为龟类进化多样化的基因组研究数据，包含19个代表性龟类基因组的单拷贝直系同源基因、26个龟类物种的二代测序标记，以及系统发育分析结果。数据用于探究龟类进化中的系统发育异质性、基因树-物种树冲突等问题，共17个文件，涵盖对齐序列、基因树、物种树、日志及补充表格等内容。文件详解压缩包文件（.zip/.tar.gz）...

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DeGiorgioDegnan_Based_物种树推断稳健性研究数据

2026年1月23日 30 43 38

数据集概述本数据集围绕物种树推断的稳健性展开，对比MP-EST、STAR、STEAC、STELLS和STEM等方法在处理最大似然与贝叶斯基因树时的表现，分析分歧时间低估对推断准确性的影响，包含1个压缩文件，用于系统发育方法的性能评估与误差机制研究。文件详解文件名称：DeGiorgioDegnanRobustness.zip 文件格式：ZIP...