数据集概述
本数据集围绕真双子叶植物MIXTA基因家族祖先(paleoMIXTA)的进化历史与功能展开,包含23种唐松草属植物paleoMIXTA直系同源基因的克隆与系统发育分析、表达模式检测、功能验证及转录组分析结果,支持研究其在锥状细胞和毛状体发育中的联合作用。
文件详解
- README.md
- 文件格式:MD
- 字段映射介绍:包含数据集标题、链接、数据收集日期等基本信息,由Simra Zahid于2024-02-29生成。
- Zahid_Schulfer_and_Di_Stilio_FPS_2023_dataset.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:数据集核心表格文件,推测包含基因表达量、功能验证结果、转录组分析等结构化数据。
- Zahid_Schulfer_and_Di_Stilio_FPS_2023_MIXTA_alignment.fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:MIXTA基因家族的序列比对文件,用于系统发育分析。
- Zahid_Schulfer_and_Di_Stilio_FPS_2023_MIXTA_phylogeny.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:MIXTA基因家族的系统发育树文件,展示基因进化关系。
数据来源
Dryad数据集(DOI: 10.5061/dryad.tdz08kq5k)
适用场景
- 植物分子进化研究: 分析MIXTA基因家族的进化历史及全基因组复制事件的影响。
- 植物表皮发育机制研究: 探究paleoMIXTA在锥状细胞和毛状体发育中的功能及调控通路。
- 基因表达模式分析: 基于qPCR数据研究不同组织(心皮、叶片)及多倍体物种中同源基因的表达差异。
- 转录组数据分析: 利用RNA-Seq数据挖掘paleoMIXTA调控的下游基因及微管相关机制。
- 基因功能验证: 通过VIGS和异源过表达实验结果,验证paleoMIXTA在表皮特征发育中的作用。