paleoMIXTA_based_植物MIXTA基因家族进化功能研究数据集

数据集概述

本数据集围绕真双子叶植物MIXTA基因家族祖先(paleoMIXTA)的进化历史与功能展开,包含23种唐松草属植物paleoMIXTA直系同源基因的克隆与系统发育分析、表达模式检测、功能验证及转录组分析结果,支持研究其在锥状细胞和毛状体发育中的联合作用。

文件详解

  • README.md
  • 文件格式:MD
  • 字段映射介绍:包含数据集标题、链接、数据收集日期等基本信息,由Simra Zahid于2024-02-29生成。
  • Zahid_Schulfer_and_Di_Stilio_FPS_2023_dataset.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:数据集核心表格文件,推测包含基因表达量、功能验证结果、转录组分析等结构化数据。
  • Zahid_Schulfer_and_Di_Stilio_FPS_2023_MIXTA_alignment.fa
  • 文件格式:FA
  • 字段映射介绍:MIXTA基因家族的序列比对文件,用于系统发育分析。
  • Zahid_Schulfer_and_Di_Stilio_FPS_2023_MIXTA_phylogeny.tre
  • 文件格式:TRE
  • 字段映射介绍:MIXTA基因家族的系统发育树文件,展示基因进化关系。

数据来源

Dryad数据集(DOI: 10.5061/dryad.tdz08kq5k)

适用场景

  • 植物分子进化研究: 分析MIXTA基因家族的进化历史及全基因组复制事件的影响。
  • 植物表皮发育机制研究: 探究paleoMIXTA在锥状细胞和毛状体发育中的功能及调控通路。
  • 基因表达模式分析: 基于qPCR数据研究不同组织(心皮、叶片)及多倍体物种中同源基因的表达差异。
  • 转录组数据分析: 利用RNA-Seq数据挖掘paleoMIXTA调控的下游基因及微管相关机制。
  • 基因功能验证: 通过VIGS和异源过表达实验结果,验证paleoMIXTA在表皮特征发育中的作用。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.82 MiB
最后更新 2026年1月21日
创建于 2026年1月21日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。