数据集概述
本数据集围绕草履虫（Paramecium tetraurelia）有性周期中多细胞核的功能协调展开，通过RNA深度测序和转录组分析，探究老细胞核对新细胞核发育的调控机制，以及基因表达与程序性基因组重排（PGR）的关联。数据集包含9个相关文件，支持对核间串扰及基因调控过程的研究。
文件详解
- DESeq2_metadata.xlsx：XLSX格式，可能包含DESeq2分析所需的样本元数据信息
- Deregulation_all_genes.xlsx：XLSX格式，记录所有基因的表达失调情况数据
- Numerical_data for Figures.xlsx：XLSX格式，提供图表对应的数值数据
- Plasmid map.zip：ZIP格式，包含质粒图谱相关文件
- qPCR_MIQE_checklist.xlsx：XLSX格式，涵盖实时定量PCR（qPCR）实验的MIQE标准检查清单数据
- qPCR_to_select_cphg.xlsx：XLSX格式，用于筛选特定基因（cphg）的qPCR数据
- Raw images.zip：ZIP格式，存储原始图像文件
- R codes.zip：ZIP格式，包含用于数据分析的R语言代码文件
- Expression_data.xlsx：XLSX格式，记录基因表达相关数据
数据来源
论文“Inter-generational nuclear crosstalk links the control of gene expression to programmed genome rearrangements during the Paramecium sexual cycle”
适用场景
- 分子生物学研究：分析草履虫有性周期中核间串扰对基因表达的调控机制
- 基因组学分析：探究程序性基因组重排（PGR）与基因表达的关联
- 转录组数据分析：利用RNA测序数据研究基因表达变化规律
- 实验方法验证：基于qPCR数据和MIQE清单，验证基因表达实验的可靠性
- 生物信息学方法应用：通过R代码复现或扩展基因表达调控的分析过程
