数据集概述
本数据集围绕鸽类宿主与羽虱寄生虫系统展开，包含7个文件，涵盖基因组测序数据、系统发育分析文件及种群遗传分析数据。通过比较翅虱（高扩散能力）与体虱（低扩散能力）的系统发育和种群遗传模式，探究寄生虫扩散对宿主-寄生虫系统多进化尺度的影响，为进化生物学研究提供基础数据。
文件详解
- 归档文件（Archive files）
- 文件名称：Distances.zip、Alignments.zip、Trees.zip、SNPs.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：分别包含距离数据、序列比对数据、系统发育树数据及单核苷酸多态性（SNP）数据，支持系统发育与种群遗传分析。
- 文本文件（Text file）
- 文件名称：columbicola_partitions.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射：定义基因组分区信息，如DNA子集的位置范围（例：Subset1 = 753360-753992, 1-492），用于系统发育分析的基因组装。
- 表格文件（CSV file）
- 文件名称：cophylogenetic_link_comp.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射：包含宿主（host）、翅虱链接（wing_link）、体虱链接（body_link）、系统发育分析结果（wing_res、body_res等）及显著性（sig）等字段，用于宿主-寄生虫共进化分析。
- XML文件（XML file）
- 文件名称：columbicola_coi.xml
- 文件格式：XML
- 内容说明：包含细胞色素c氧化酶I（COI）基因相关的元数据，支持基因序列分析。
数据来源
论文“The role of parasite dispersal in shaping a host-parasite system at multiple evolutionary scales”
适用场景
- 宿主-寄生虫系统进化分析：通过系统发育树与共进化链接数据，研究羽虱与鸽类宿主的共进化模式及寄生虫扩散的影响。
- 种群遗传结构研究：利用SNPs数据与种群遗传参数（如杂合度、种群结构），分析羽虱的种群分化与扩散能力的关联。
- 基因组进化分析：通过基因组序列比对与分区数据，探究羽虱基因组的进化特征及与宿主的关联。
- 生物地理学研究：结合种群遗传结构与地理分布数据，分析羽虱种群结构的生物地理驱动因素。
- 进化生物学方法验证：为寄生虫扩散能力对宿主-寄生虫系统多尺度影响的研究提供数据支撑，验证相关进化理论。
