数据集概述
本数据集围绕肯尼亚家麻雀约七十年范围扩张过程中的表观遗传潜力展开研究，包含五个区域的CpG位点数量及DNA甲基化数据。核心探索CpG位点数量在扩张前沿与核心区域的分布差异，分析其是否受选择驱动，以及DNA甲基化在扩张中的变化规律，为表观遗传机制推动物种扩张提供数据支撑。
文件详解
- README.docx：DOCX格式，提供数据集的研究背景、实验设计、文件说明等文档内容
- populations.snps.vcf：VCF格式，包含不同种群的单核苷酸多态性（SNP）数据
- SNP_count.txt：TXT格式，记录各位置的SNP类型及数量，字段包括location、AtoT、AtoC、AtoG、TtoA、TtoC、TtoG、CtoA、CtoT、CtoG、GtoA、GtoT、GtoC等多种碱基替换类型，以及CGtoAG、CGtoTG等CpG相关替换类型的计数
- CG.vcf.fasta：FASTA格式，包含CpG位点相关的序列数据
- HPA_locus_counts.txt：TXT格式，记录HPA基因座的计数信息
- nonCG.vcf.fasta：FASTA格式，包含非CpG位点相关的序列数据
数据来源
论文“Epigenetic potential and DNA methylation in an ongoing House Sparrow (Passer domesticus) range expansion”
适用场景
- 物种范围扩张表观遗传机制研究：分析CpG位点数量在扩张前沿与核心区域的分布差异，探究表观遗传潜力对物种扩张的驱动作用
- 选择驱动表观遗传变异分析：验证CpG位点数量模式是否由选择驱动，为适应性进化研究提供数据
- DNA甲基化与表型可塑性关联研究：探索DNA甲基化在物种扩张过程中的稳定性及与表型可塑性的关系
- 生物入侵适应性机制研究：为自然及人为导致的物种范围扩张中表观遗传驱动机制的研究提供参考
