数据集概述
本数据集为Canary Islands濒危帽贝Patella candei candei的遗传分化研究数据，包含SNP数据集及COX1序列分析输入文件，支持种群遗传结构、物种分类关系及保护单元划分的研究，共5份文件。
文件详解
- README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明数据集内容，包括VCF格式SNP数据、MEGA和BEAST的COX1序列输入文件来源（Quinteiro et al.2022）
- Stacks_pipeline_SNPs_dataset._stacks_46x2136_snps.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：Stacks流程生成的SNP数据集，包含46个样本的2136个单核苷酸多态性位点信息
- dDocent_pipeline_SNPs_dataset._dDocIV_54x3092_snps_edit.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：dDocent流程生成的编辑后SNP数据集，包含54个样本的3092个单核苷酸多态性位点信息
- Patella_Alignment_COX1_v15.2._MEGA_input.meg
- 文件格式：MEG
- 字段映射介绍：Patella属COX1基因序列比对文件，用于MEGA软件的遗传分析输入
- Patella_Alignment_COX1_v15.2.nex.beauti._BEAST_input.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：Patella属COX1基因序列比对文件，用于BEAST软件的系统发育分析输入
适用场景
- 濒危物种遗传结构分析: 利用SNP数据集研究Patella candei candei种群的遗传分化程度与基因流模式
- 物种分类关系验证: 通过COX1序列分析明确Patella candei candei与近缘亚种的分类边界
- 保护单元划分: 基于遗传分化结果确定优先保护的种群单元，支持濒危物种恢复计划制定
- 分子进化研究: 结合SNP与线粒体基因数据，分析帽贝适应环境的分子进化机制
- 生物多样性监测: 为Canary Islands海洋濒危物种的长期遗传多样性监测提供基线数据
