数据集概述
本数据集记录了“植物宿主与土壤来源对木本植物根系真菌和细菌群落的影响”实验的相关数据，包含实验设计、样本测序结果及数据分析文件，涉及Populus、Quercus、Pinus三种木本植物，通过454扩增子测序分析16S、SSU、ITS、LSU rDNA四个基因位点的微生物群落，共10个文件。
文件详解
- 测序数据文件（.gz格式）
- 文件名称：16S_host_denoised_by_SampleID.fasta.tar.gz、28S_host_denoised_by_SampleID.fasta.tar.gz、18S_host_denoised_by_SampleID.fasta.tar.gz、ITS2_host_denoised_by_SampleID.fasta.tar.gz、ITS1_host_denoised_by_SampleID.fasta.tar.gz
- 文件格式：.gz（压缩包）
- 字段映射介绍：包含按样本ID去噪后的16S、28S、18S核糖体RNA基因及ITS1、ITS2内转录间隔区的微生物序列数据
- 序列数据集文件（.fasta格式）
- 文件名称：ITS1.fna_rep_set.fasta
- 文件格式：.fasta
- 字段映射介绍：ITS1区域的代表性序列数据集
- 生长数据文件（.xls格式）
- 文件名称：PopulusBioassayGrowth.xls
- 文件格式：.xls
- 字段映射介绍：记录Populus植物在生物测定实验中的生长相关数据
- 样本信息文件（.xlsx格式）
- 文件名称：bonito_samples_GB.xlsx、ITS1_otu_tableSortedSoil.xlsx
- 文件格式：.xlsx
- 字段映射介绍：包含样本的基础信息及按土壤分类的ITS1区域操作分类单元（OTU）表
- 系统发育分析文件（.nex格式）
- 文件名称：Glomeromycota_454_Host_All.nex
- 文件格式：.nex
- 字段映射介绍：球囊菌门（Glomeromycota）的454测序数据系统发育分析文件
数据来源
标题为“Data from: Plant host and soil origin influence fungal and bacterial assemblages in the roots of woody plants”的研究
适用场景
- 植物微生物群落研究: 分析木本植物根系真菌和细菌群落的组成及结构特征
- 宿主与土壤因子影响分析: 探究植物宿主种类和土壤来源对根系微生物群落的影响机制
- 微生物多样性评估: 基于测序数据评估不同木本植物根系微生物的多样性水平
- 生态关联分析: 研究根系微生物群落与植物生长、土壤环境之间的生态关联
- 系统发育研究: 开展球囊菌门等特定微生物类群的系统发育分析
