Polyploidy_Database_多倍体植物物种形成速率研究数据

数据集概述

本数据集围绕多倍体植物的宏观进化影响展开，包含数百个多倍化事件的分析结果，验证了多倍体植物相较于二倍体植物具有更低的物种形成速率和更高的灭绝速率的结论。数据集包含2个文件，涵盖植物多倍体演化速率相关的数据库及说明文档。

文件详解

• README_for_polyploidy_database.txt
• 文件格式：TXT
• 字段映射介绍：说明数据库包含63个存在倍性变异的系统发育树，每个文件夹含5类文件（系统发育树及关联数据），并列出各文件类型（.fa、.otgrp、.mb_trees等）的用途。
• polyploidy_database.zip
• 文件格式：ZIP
• 字段映射介绍：压缩包内包含数据库完整内容，含多序列比对（FASTA格式）、外类群分类单元列表、MCMC树样本等系统发育分析相关文件。

适用场景

• 植物多倍体演化研究：分析多倍体植物与二倍体植物的物种形成速率及灭绝速率差异。
• 系统发育树构建：利用多序列比对数据构建最大似然树和贝叶斯树。
• 物种分化分析：基于MCMC树样本进行BiSSE多样化分析。
• 多倍体进化假说验证：量化验证多倍体植物的“进化死胡同”假说。