数据集概述
本数据集围绕毛果杨（Populus trichocarpa）MATE转运蛋白家族展开全基因组分析，探究其在铝抗性中的分子机制。包含71个候选MATE基因的染色体分布、系统发育关系及表达分析结果，重点验证PtrMATE1和PtrMATE2在铝胁迫下的功能，为林木抗逆分子机制研究提供数据支持。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_for_MATE ptoteins.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含MATE转运蛋白分析相关背景、实验方法及文件清单等信息
- 文本文件
- 文件名称：MATE ptoteins.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含毛果杨MATE蛋白序列信息（如PtrDTX1的氨基酸序列）
- 表格文件
- 文件名称：TABLE. S1.xlsx、TABLE. S2.xlsx、TABLE. S3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充表格，包含MATE基因家族分析的详细数据（如基因列表、表达量统计等）
- 图像文件
- 文件名称：Fig.S1.tif、Fig.S2.tif、Fig.S3.tif、Fig.S4.tif、Fig.S5.tif、Fig.S6.tif
- 文件格式：TIF
- 字段映射介绍：实验结果图，包含系统发育树、基因表达模式、亚细胞定位等可视化数据
数据来源
论文“Genome-wide analysis of MATE transporters and molecular characterization of aluminum resistance in Populus”
适用场景
- 林木抗逆分子机制研究: 分析毛果杨MATE转运蛋白在铝胁迫响应中的功能及调控机制
- 植物基因家族进化分析: 基于全基因组数据探究MATE基因家族的染色体分布及系统发育关系
- 基因功能验证: 验证PtrMATE1/2等候选基因在铝抗性中的作用，为基因工程改良提供靶点
- 抗逆分子育种: 挖掘毛果杨铝抗性相关基因资源，应用于林木抗逆品种选育
