数据集概述
本数据集包含肉鸡在不同日龄（7日、15日、33日）和不同处理（孵化蛋壳温度、大肠杆菌感染、IBV疫苗接种）下的肺组织转录组与表观遗传数据，以RDS、TXT和Excel格式存储，共23个文件，用于研究早期孵化温度对肉鸡后期免疫与健康的影响机制。
文件详解
- RDS文件（11个）
- 文件名称：遵循
KB_Resp_DESeq2_model_[日龄]_[处理条件].rds模式（如KB_Resp_DESeq2_model_day7_comp_est_treatment.rds）
- 文件格式：RDS
- 字段映射介绍：存储DESeqDataSet对象，包含DESeq2差异表达分析模型结果，对应不同日龄（7/15/33日）和处理条件（EST温度、大肠杆菌、IBV疫苗）的转录组数据
- TXT文件（11个）
- 文件名称：遵循
KB_Resp_normalized_counts_[日龄]_[处理条件].txt模式（如KB_Resp_normalized_counts_day7_comp_est_treatment.txt）
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：存储标准化测序计数数据，包含基因ID及对应样本的标准化表达量
- Excel文件（1个）
- 文件名称：RNA_metadata_organism.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含样本元数据，记录实验设计、样本分组、处理条件等信息
数据来源
NCBI-SRA BioProject: PRJNA949139
适用场景
- 肉鸡表观遗传学研究: 分析不同孵化温度下肉鸡肺组织的差异甲基化位点及相关通路
- 转录组差异表达分析: 研究孵化温度、大肠杆菌感染、IBV疫苗对肉鸡不同日龄肺组织基因表达的影响
- 肉鸡免疫机制研究: 挖掘免疫相关差异表达基因，解析早期孵化条件对后期呼吸道免疫的调控机制
- 生物信息学模型验证: 利用DESeq2模型结果验证转录组分析方法在畜禽研究中的应用
- 畜禽健康养殖研究: 为优化肉鸡孵化条件、提升后期抗病能力提供分子生物学依据
