数据集概述
本数据集围绕Project TIN CANN项目展开,通过先按细胞簇子集化所有细胞、再按处理分组的方式,探究差异表达(DA)标记基因。包含多种格式的文件,为相关生物学研究提供数据支持。
文件详解
- 数据文件(CSV格式):
- 示例文件:C5_markerList_2024-10-17.csv、C1_markerList_2024-10-17.csv等,共54个
- 核心字段:group(分组)、group_name(分组名称)、seqnames(序列名称)、start(起始位置)、end(终止位置)、strand(链方向)、name(基因名称)、idx(索引)、Log2FC(对数倍变化)、FDR(错误发现率)、MeanDiff(均值差异)
- 文档文件(PDF格式):
- 示例文件:C18_TxComp_Heatmap_2024-10-18.pdf、C21_TxComp_Heatmap_2024-10-18.pdf等,共25个
- 内容:可能包含处理比较相关的热图等可视化结果
- 栅格文件(PNG格式):
- 示例文件:q-2a-2b_gene_tally_by_tx-Cluster_Barplot_2024-11-08.png,共1个
- 内容:按处理-细胞簇分组的基因计数条形图
适用场景
- 分子生物学研究:分析不同细胞簇在不同处理下的差异表达标记基因
- 生物信息学分析:基于基因表达数据进行差异表达分析、可视化展示等
- 医学相关研究:探究处理因素对细胞基因表达的影响及潜在机制
- 实验数据验证:辅助验证细胞簇分类及处理相关的基因表达结果