找到17个数据集

标签: 基因计数

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  • Amprenavir_Based_食管细胞转录组变化研究数据

    2026年1月29日 30 133 87

    数据集概述 本数据集包含Amprenavir干预胃蛋白酶诱导的正常(Het-1A)和癌前(BAR-T)食管细胞转录组变化的研究数据,涵盖基因计数、外显子计数、差异表达基因分析等18个Excel文件,用于探究药物对食管细胞转录组的调控作用。 文件详解 正常食管细胞(Het-1A)相关文件...
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  • CRC_Based传统治疗诱导肿瘤免疫编辑及免疫微环境调控研究数据

    2026年1月27日 30 143 19

    数据集概述 本数据集围绕结直肠癌(CRC)传统治疗对肿瘤免疫编辑及免疫微环境的影响展开,包含转移性CRC患者接受mFOLFOX6联合贝伐珠单抗新辅助治疗前后的多组学数据,涵盖外显子测序、RNA测序及新抗原预测结果,可用于分析治疗对肿瘤免疫特性的调控机制。 文件详解 WES_sequenza_CNVs.tsv 文件格式:TSV...
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  • ScISOr_Seq_Based三刺鱼单细胞测序基因组注释优化数据

    2026年1月27日 30 176 9

    数据集概述 本数据集为单细胞Iso-Seq技术优化基因组注释的补充数据,包含通过ScISOr-Seq技术生成的三刺鱼基因模型注释文件、CellRanger输出信息、Iso-Seq处理数据等,可提升scRNAseq分析中基因计数完整性与细胞类型识别准确性,支持基因组注释优化研究。 文件详解 文档文件 文件名称:README.txt 文件格式:TXT...
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  • MCE_Based_墨西哥湾与伯利兹洞穴滨珊瑚转录组可塑性研究数据

    2026年1月27日 30 18 15

    数据集概述 本数据集聚焦洞穴滨珊瑚(Montastraea cavernosa)在墨西哥湾及伯利兹中光层珊瑚生态系统(MCEs)的转录组可塑性,包含自然种群观测与移植实验的基因表达、环境参数及共生体叶绿素数据,用于分析珊瑚对不同深度与环境胁迫的适应机制,共11个文件。 文件详解 代码文件(.r格式,共8个) Studivan-and-...
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  • Acropora_millepora_Based珊瑚昼夜转录组代谢交互研究数据

    2026年1月19日 30 87 78

    数据集概述 本数据集聚焦鹿角珊瑚(Acropora millepora)昼夜转录组差异,通过比较光照与黑暗条件下的基因表达水平,探究珊瑚与共生甲藻的代谢交互机制及光增强钙化(LEC)的分子基础。包含差异表达基因分析结果、基因计数数据及补充文件,共4份文件。 文件详解 Day_Vs_Night_EdgeR.txt 文件格式:TXT...
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  • DMY_Based_RNA_Seq与small_RNA_Seq处理文件及分析代码数据

    2026年1月18日 30 109 28

    数据集概述 本数据集包含DMY相关RNA-Seq和small RNA-Seq的处理文件与分析代码,涉及基因与miRNA的计数、表达量(FPKM/RPM)、差异分析结果及可视化脚本等,支持生物医学领域基因表达相关研究,共15个文件。 文件详解 基因表达数据文件...
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  • Repbase_Supplementary_Repbase重复序列与R基因结构域数据

    2026年1月18日 30 119 116

    数据集概述 本数据集包含Repbase数据库中的重复序列信息,以及其中含有的R基因相关重复序列计数,同时涵盖油菜(B. napus)和芜菁(B. rapa)不同注释版本中的R基因候选数据,以补充表格形式呈现,支持植物基因组抗病相关研究。 文件详解 文件名称:Supplementary_Tables.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • Comparative_Genomics_Based_七株环境细菌分离株基因组比较分析数据集

    2026年1月17日 30 172 125

    数据集概述 本数据集包含七株环境来源细菌分离株的比较基因组学分析结果,涉及芳香族化合物、异生物质降解能力及重金属抗性的注释与分析数据。共12个文件,涵盖基因组注释压缩包、BacMet2分析压缩包及基因计数、抗性蛋白统计表格,为环境微生物功能研究提供基础数据。 文件详解 基因组注释文件(RASTtk Annotation)...
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  • LKRSDH_Histone_Modifications_昼夜节律年龄变化研究数据

    2026年1月15日 30 106 76

    数据集概述 本数据集包含论文《LKRSDH-dependent histone modifications of insulin-like peptide sites contribute to age-related circadian rhythm changes》的相关数据与脚本,涉及RNA-seq、CHIP-...
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  • Demodifying_RNA_Based_FFPE样本转录组分析优化实验数据2017

    2026年1月14日 30 164 44

    数据集概述 本数据集包含甲醛固定石蜡包埋(FFPE)样本RNA去修饰方法优化实验的结果数据,涉及不同保存方式(冷冻、乙醇、甲醛固定)及去修饰方案对RNA质量、测序指标和转录组分析结果的影响,共16个文件,为FFPE样本基因组研究提供方法参考。 文件详解 数据文件(.xlsx格式,共13个)...
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  • HER2_breast_carcinomas_抗Yo副肿瘤性小脑变性免疫遗传特征补充数据

    2026年1月13日 30 185 106

    数据集概述 本数据集为HER2驱动乳腺癌触发抗Yo副肿瘤性小脑变性(Yo-PCD)相关研究的补充表格与基因表达数据,包含差异基因表达分析结果、基因本体富集分析结果及基因计数、转录本每百万读数(TPM)数据,共5个文件,支持对该疾病免疫遗传机制的深入研究。 文件详解 差异基因表达分析结果 文件名称:eTable 1.xlsx 文件格式:XLSX...
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  • ALD_Modifier_Project_Based_X_连锁肾上腺脑白质营养不良_ALD_患者脑脱髓鞘表型的多组学研究数据

    2025年12月27日 30 8 6

    数据集概述 本数据集包含用于支持论文研究的多组学数据表,涵盖甲基化、RNA、蛋白质组和脂质组四类组学技术的标准化测量数据,无身份识别信息。数据用于识别X-连锁肾上腺脑白质营养不良中脑脱髓鞘的表型修饰因子,共包含十一个文件,支持研究结果的复现与进一步分析。 文件详解 样本映射文件 文件名称:20180314_sib_pairs.xlsx...
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  • 工业化人类纤维素降解肠道细菌隐性多样性数据集

    2025年12月20日 30 151 32

    数据集概述 该数据集围绕工业化人类肠道中纤维素降解细菌的隐性多样性展开,包含33个相关文件,涉及系统发育树、基因分布数据及图表等内容,为研究肠道微生物与西式生活方式的关联提供数据支持。 文件详解 核心数据文件:...
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  • IF1Ty_IF1KO_IF1Over弓形虫株RNAseq分析脚本数据集

    2025年12月19日 30 103 68

    数据集概述 本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本、NGS文库质量控制文档及参考基因组文件,支持基因表达分析流程的复现与验证。 文件详解 文件名称: ToxoDB-65_TgondiiME49_Genome.fasta,文件格式: FASTA,内容: 弓形虫ME49株v65版本参考基因组序列 文件名称:...
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  • GBA1突变患者α_突触核蛋白预成纤维与小鼠嗅球播种功效关联数据集

    2025年12月19日 30 113 60

    数据集概述 本数据集围绕GBA1突变患者来源的α-突触核蛋白预成纤维及宿主小鼠基因型对嗅球播种功效的影响展开,包含实验数据、分析结果及图表文件,支持相关机制研究与数据分析。 文件详解 数据文件(.tsv格式): string_MCL_clusters.tsv:含聚类方法、簇编号、基因计数、蛋白名称等字段,记录蛋白聚类结果 cluster...
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  • Project_TIN_CANN_标记基因按细胞簇子集化并按处理分组数据集2024

    2025年12月14日 30 16 7

    数据集概述 本数据集围绕Project TIN CANN项目展开,通过先按细胞簇子集化所有细胞、再按处理分组的方式,探究差异表达(DA)标记基因。包含多种格式的文件,为相关生物学研究提供数据支持。 文件详解 数据文件(CSV格式):...
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  • Project_TIN_CANN_处理分组下的聚类标记基因子集

    2025年12月7日 30 142 129

    数据集概述 该数据集为Project TIN CANN的研究成果,通过按处理分组筛选细胞后再按聚类分组,探究差异表达(DA)标记基因。包含CSV格式的基因数据文件、PDF格式的热图文档及JPG格式的基因计数图片,覆盖基因序列、表达量变化及统计指标等信息。 文件详解 数据文件(CSV格式,共51个):...
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