数据集概述
本数据集是海洋硅藻Pseudo-nitzschia multistriata的系统基因组学资源，包含基于约9000个该硅藻基因构建的系统发育树，以及与古菌、细菌和真核生物主要类群的同源序列（超200万条）的比较数据。每个同源组通过两种不同替代模型构建树，序列ID含分类信息，支持基因进化关系分析。
文件详解
- 文件名称：
treeData.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包包含系统基因组学相关文件，核心内容包括：
p.multistriata_gene_tree.txt：Pseudo-nitzschia multistriata蛋白与系统发育树的映射关系文件geneDB.txt：所有系统发育树中蛋白ID的详细描述文件treeJTT文件夹：使用JTT替代模型生成的系统发育树文件treeWAG文件夹：使用WAG替代模型生成的系统发育树文件
数据来源
论文“Basu et al., 2017”相关研究
适用场景
- 海洋硅藻基因进化研究：分析Pseudo-nitzschia multistriata基因与其他生物同源序列的进化关系
- 系统发育树构建方法比较：对比JTT和WAG两种替代模型生成的树结构差异
- 跨物种同源基因分析：基于超200万条同源序列研究古菌、细菌和真核生物的基因关联
- 海洋微生物基因组学研究：为海洋硅藻及相关微生物的基因组功能分析提供基础数据支持
