数据集概述
本数据集包含用于PSMC（成对序列马尔可夫合并）方法分析RAD（限制性位点关联DNA）测序数据的代码文件和实证数据。内容涉及PSMC方法在RAD数据中的适用性研究，包括模拟分析和实证案例，旨在为RAD数据的PSMC分析提供指导，共包含4个文件。
文件详解
- 代码文件（.r格式）
- 文件名称：stacks2psmcfa.r、ms2psmcfa.r、plotPsmc.r
- 文件格式：R脚本
- 字段映射介绍：包含用于RAD测序数据转换为PSMC输入格式（stacks2psmcfa.r、ms2psmcfa.r）及PSMC结果可视化（plotPsmc.r）的分析代码
- 实证数据文件
- 文件名称：empirical data(psmcfa files).zip
- 文件格式：ZIP压缩包
- 字段映射介绍：包含实证分析所用的psmcfa格式数据文件，涉及三刺鱼RAD测序数据的PSMC分析结果
适用场景
- 生物信息学方法验证: 研究PSMC方法在RAD测序数据中的适用性及参数优化
- 群体遗传学研究: 利用RAD测序数据进行物种 demographic history（种群历史）分析
- 基因组数据分析: 探索RAD位点中包含的合并信息在群体遗传学研究中的应用
- 生物信息学工具开发: 为针对RAD数据的PSMC分析工具优化提供参考
