数据集概述
本数据集为PXD057215项目的蛋白质稳定同位素探测（protein-SIP）数据分析结果，支持微生物群落的物种水平分辨率研究。包含两个经处理的Excel文件，分别整合了Unipept与MetaProSIP输出数据，以及未匹配参考数据库或UniProt的肽段BLASTp结果，可用于微生物群落组成与功能分析。
文件详解
- PXD057215_Unipept_MetaProSIP_merged.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：整合Unipept（肽段分类工具）与MetaProSIP（蛋白质SIP数据分析工具）的输出数据，包含微生物肽段的分类、丰度及同位素标记相关信息。
- PXD057215_Blast_Others.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：记录未在参考数据库或UniProt中匹配到的肽段的BLASTp比对结果，包含肽段序列、比对同源序列及相似度等信息。
数据来源
论文“De novo peptide databases enable protein-based stable isotope probing of microbial communities with up to species-level resolution”
适用场景
- 微生物群落物种组成分析: 通过整合数据识别微生物群落中的物种，实现物种水平分辨率的群落结构解析。
- 蛋白质稳定同位素探测研究: 分析同位素标记肽段的分布，探究微生物群落的功能活性与代谢偏好。
- 宏蛋白质组学数据补充分析: 利用未匹配肽段的BLASTp结果，挖掘参考数据库外的微生物遗传信息。
- 微生物生态学研究: 支持微生物群落与环境因子关联分析，揭示生态系统中微生物的作用机制。
