数据集概述
本数据集为墨西哥手树(Chiranthodendron pentadactylon)的核系统地理学研究数据,包含基于RAD测序的核DNA序列分析及生态位建模结果,涉及墨西哥和危地马拉种群的遗传结构、分化时间、 demographic趋势等信息,支持对该物种第四纪演化历史及云林片段化影响的研究。
文件详解
- Additional_file_1_Taxon_sampling_geographic_location_and_voucher.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:记录分类群采样的地理位置及凭证信息,包含采样点分布、个体数量等基础采样数据
- Additional_file_2_RADseq_de_novo_assembly_stats.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:RAD测序从头组装的统计数据,涵盖组装质量相关指标
- Additional_file_3_Nuclear_loci_sequences_matrix.nex
- 文件格式:NEX
- 字段映射介绍:核基因座序列矩阵,存储用于系统地理学分析的DNA序列数据
- Additional_file_4._Substitution_models.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:替代模型相关文档,记录序列分析中使用的进化模型参数
- Additional_file_5._Evanno_method_results.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:Evanno方法分析结果,包含遗传结构分析中的种群划分相关数据
数据来源
论文“Nuclear phylogeography of the temperate tree species Chiranthodendron pentadactylon (Malvaceae): Quaternary relicts in Mesoamerican cloud forests”
适用场景
- 植物系统地理学研究: 分析墨西哥手树种群遗传结构及特万特佩克地峡对种群分化的影响
- 第四纪气候变化与物种演化关联分析: 探究更新世气候波动对该物种分布及种群动态的作用
- 云林片段化遗传效应研究: 评估墨西哥手树种群空间隔离与云林片段化的遗传关联
- 生态位模型验证: 结合遗传数据与生态位模型结果,验证物种潜在分布对历史气候的响应
- 植物保护策略制定: 基于种群遗传多样性及分化特征,为墨西哥手树保护提供科学依据