鞘毛藻转录组中苯丙烷生物合成关键酶同源蛋白编码转录本系统发育数据集

数据集概述

本数据集包含鞘毛藻转录组中苯丙烷生物合成关键酶同源蛋白编码转录本的系统发育分析结果。数据基于de Vries等(2021)的比对文件扩展,经MAFFT重新比对后,用IQ-TREE和ModelFinder构建系统发育树,涵盖CAD、CSE、CCR等多类酶的分析文件。

文件详解

  • PDF文档文件(共8个):记录系统发育分析结果,如CADphylogeny.pdf、COMTphylogeny.pdf、CCRphylogeny.pdf等,展示不同酶的系统发育树可视化结果。
  • Treefile文件(共8个):存储系统发育树数据,如CSE_alignment.linsi.fasta.treefile、4CL_alignment.linsi.fasta.treefile等,包含重新比对后的序列构建的系统发育树结构信息。

适用场景

  • 植物进化生物学研究:分析苯丙烷生物合成关键酶在鞘毛藻中的系统发育关系。
  • 分子生物学研究:探究鞘毛藻转录组中同源蛋白编码基因的进化模式。
  • 比较基因组学分析:对比不同物种苯丙烷合成酶家族的辐射分化过程。
  • 藻类代谢途径研究:辅助解析鞘毛藻苯丙烷生物合成途径的分子基础。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.55 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
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