数据集概述
本数据集为川滇高山栎气候适应性研究相关数据，涵盖60个种群587个个体的干旱胁迫候选基因测序结果，包含381个SNP位点与8个微卫星标记的遗传信息，支持分析该物种不同谱系（西藏、横断山-川西高原）的遗传多样性、适应性位点及未来气候适应风险。
文件详解
- 文件名称：SSR_All.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含8个微卫星标记的全种群遗传数据
- 文件名称：SNP_Tibet_MAF_2.5_Mis50.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：西藏谱系满足MAF≥2.5%、缺失率≤50%的SNP位点数据
- 文件名称：SNP_HDM-WSP_MAF_2.5_Mis50.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：横断山-川西高原谱系满足MAF≥2.5%、缺失率≤50%的SNP位点数据
- 文件名称：SNP_All.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：所有65个候选基因中381个SNP位点的原始变异数据
- 文件名称：SNP_All_MAF_2.5_Mis50.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：全种群满足MAF≥2.5%、缺失率≤50%的SNP位点数据
数据来源
论文“Contrasted patterns of local adaptation to climate change across the range of an evergreen oak, Quercus aquifolioides”
适用场景
- 植物遗传多样性分析: 研究川滇高山栎不同地理种群的遗传结构与多样性水平
- 气候适应性位点鉴定: 通过SNP数据筛选响应干旱等气候因子的适应性基因位点
- 谱系分化研究: 对比西藏与横断山-川西高原谱系的遗传差异及适应机制
- 未来气候适应风险评估: 基于RONA分析框架预测不同谱系对未来气候变化的适应能力
- 植物分子生态学研究: 探索长寿命树种在异质环境中的局部适应过程与遗传基础
