RAD_seq_Based东亚葡萄物种网状进化研究数据

数据集概述

本数据集为探究东亚四种近缘葡萄物种(山葡萄、秋葡萄、陕西葡萄、毛葡萄)网状进化的RAD-seq测序数据,含46份覆盖形态与地理变异的样本,通过群体结构分析等揭示其复杂进化模式,支持同域种群间基因渐渗的存在,为东亚葡萄物种网状进化提供证据。

文件详解

  • 文件名称:RAD_Vitis_filter_VCF.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 字段映射介绍:压缩包包含经过滤的VCF格式数据,推测涵盖RAD-seq测序获得的单核苷酸多态性(SNP)位点信息,涉及样本基因型、等位基因频率等群体遗传分析所需字段。

数据来源

论文“Testing reticulate evolution of four Vitis species from East Asia using restriction‐site associated DNA sequencing”

适用场景

  • 植物进化生物学研究:分析东亚葡萄物种的系统发育关系与网状进化模式。
  • 群体遗传学分析:利用SNP数据开展种群结构、基因渐渗与杂交事件的检测。
  • 生物多样性保护:为东亚特有葡萄物种的遗传多样性评估与保护策略制定提供依据。
  • 分子标记开发:基于RAD-seq数据挖掘葡萄物种遗传分化相关的分子标记。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 242.97 MiB
最后更新 2026年1月30日
创建于 2026年1月30日
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