数据集概述
本数据集通过RAD测序分析北美湖白鲑物种对在基因流物种形成过程中的遗传结构,比较五个湖泊中物种对的基因组分化模式,识别抗基因渗入区域并推导屏障强度。数据反映遗传分化受选择位点连锁、生态位分化强度及湖泊特有种群特征影响,为解析物种形成机制提供支撑。
文件详解
- 5_Lakes_Mapped_2734_FST.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含Order(序号)、Order_Map(图谱序号)、Locus_Name(位点名称)、LG(连锁群)、Map_Position(图谱位置)、Cliff_FST、Indian_FST、Webster_FST、East_FST、Temis_FST(五个湖泊的遗传分化指数)等字段
- Genomic_Islands.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含基因组分化岛相关数据
- Genotypes_5_Lakes_3438_Markers.arp
- 文件格式:ARP
- 内容说明:包含五个湖泊3438个标记的基因型数据
- Inferred_haplotypes.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含推断的单倍型相关数据
数据来源
论文“The genetic architecture of reproductive isolation during speciation-with-gene-flow in lake whitefish species pairs assessed by RAD sequencing”
适用场景
- 物种形成机制研究:分析基因流背景下湖白鲑物种对的生殖隔离遗传结构
- 基因组分化模式分析:探究五个湖泊中湖白鲑物种对的基因组分化岛特征及影响因素
- 遗传屏障强度评估:基于重组距离推导湖白鲑物种间基因渗入的屏障强度
- 生态适应性进化研究:解析湖白鲑对不同生态位的遗传适应机制及表型分化关联