RAD_Sequencing_Based_湖白鲑基因流物种形成遗传结构研究数据

数据集概述

本数据集通过RAD测序分析北美湖白鲑物种对在基因流物种形成过程中的遗传结构,比较五个湖泊中物种对的基因组分化模式,识别抗基因渗入区域并推导屏障强度。数据反映遗传分化受选择位点连锁、生态位分化强度及湖泊特有种群特征影响,为解析物种形成机制提供支撑。

文件详解

  • 5_Lakes_Mapped_2734_FST.txt
  • 文件格式:TXT
  • 字段映射介绍:包含Order(序号)、Order_Map(图谱序号)、Locus_Name(位点名称)、LG(连锁群)、Map_Position(图谱位置)、Cliff_FST、Indian_FST、Webster_FST、East_FST、Temis_FST(五个湖泊的遗传分化指数)等字段
  • Genomic_Islands.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 内容说明:包含基因组分化岛相关数据
  • Genotypes_5_Lakes_3438_Markers.arp
  • 文件格式:ARP
  • 内容说明:包含五个湖泊3438个标记的基因型数据
  • Inferred_haplotypes.zip
  • 文件格式:ZIP(压缩包)
  • 内容说明:包含推断的单倍型相关数据

数据来源

论文“The genetic architecture of reproductive isolation during speciation-with-gene-flow in lake whitefish species pairs assessed by RAD sequencing”

适用场景

  • 物种形成机制研究:分析基因流背景下湖白鲑物种对的生殖隔离遗传结构
  • 基因组分化模式分析:探究五个湖泊中湖白鲑物种对的基因组分化岛特征及影响因素
  • 遗传屏障强度评估:基于重组距离推导湖白鲑物种间基因渗入的屏障强度
  • 生态适应性进化研究:解析湖白鲑对不同生态位的遗传适应机制及表型分化关联
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.03 MiB
最后更新 2026年1月19日
创建于 2026年1月19日
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