数据集概述
本数据集围绕沼蛙(Rana arvalis)C/EBP-1基因展开,涵盖德国至瑞典北部5个纬度梯度区域的遗传与表型数据,用于研究该转录因子在幼虫发育适应气候梯度中的遗传基础、选择压力及与表型变异的关联,包含基因分型、SNP数据和共同花园实验表型数据三类文件。
文件详解
- C_EBP_genotypes_364_individuals.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:记录364个沼蛙个体的C/EBP-1基因分型数据,包含个体来源区域、基因型等信息,用于分析基因多样性及纬度梯度分布特征。
- R_arvalis_gradient_1000SNPs_136_individuals_genepop_format.txt.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:采用Genepop格式存储136个个体的1000个SNP位点数据,包含种群标识、个体编号及各SNP位点基因型,用于群体遗传结构及选择压力分析。
- Phenotypic_data_common_garden_126_families.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:记录126个家系的共同花园实验表型数据,包含区域、种群、家系、个体编号、变态体重、幼虫发育期等字段,用于关联基因型与表型变异。
适用场景
- 两栖动物遗传适应性研究:分析C/EBP-1基因在纬度梯度中的多样性、选择压力及与幼虫发育表型的关联。
- 群体遗传学分析:利用SNP数据研究沼蛙种群遗传结构、分化及历史 colonization 路线。
- 表型-基因型关联研究:通过共同花园实验表型数据,验证C/EBP-1基因对幼虫发育时间的功能影响。
- 气候变化适应性机制研究:探讨两栖动物应对气候梯度的遗传适应机制,为物种保护提供理论依据。