数据集概述
本数据集围绕草原坑洼区北部豹蛙（Rana pipiens）的遗传连通性展开，通过景观遗传学分析探究土地利用与地形对其种群遗传分化的影响。包含22个采样点的SNP基因分型数据、10类景观变量的栅格数据及连通性建模结果，共33个文件，为两栖动物保护及栖息地管理提供科学依据。
文件详解
- 栅格数据文件
- 文件名称：包含Waraniak_Rpip_raster_soybeansfreq.asc、Waraniak_Rpip_raster_roughness.asc等11个.asc格式文件
- 文件格式：ASC
- 字段映射介绍：记录玉米/大豆/小麦种植频率、地形粗糙度、热负荷、道路密度、距永久湿地距离等10类景观变量的空间栅格数据
- 元数据文件
- 文件名称：包含对应栅格数据的12个.xml格式元数据文件（如Waraniak_Rpip_raster_soybeansfreq_metadata.xml）
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：描述各栅格数据的生成方法、空间参考、变量定义等元信息
- 遗传分析文件
- 文件名称：Waraniak_Rpip_connectivity_filtered.vcf、Waraniak_Rpip_connectivity_genepop.gen等
- 文件格式：VCF、GEN、TXT
- 字段映射介绍：包含豹蛙种群SNP分型数据、STRUCTURE聚类结果、遗传分化指数（Fst、Gst等）及样本点位信息
- 连通性建模文件
- 文件名称：Waraniak_AutoCircuitscape_Rpip_connect_genediff.txt、Waraniak_AutoCircuitscape_samplepoints.asc
- 文件格式：TXT、ASC
- 字段映射介绍：记录Circuitscape建模得到的遗传连通性结果、采样点空间分布数据
- 说明文件
- 文件名称：README.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：数据集整体说明，含分析方法、文件清单及使用指引
数据来源
论文“Over the hills and through the farms: Land use and topography influence genetic connectivity of northern leopard frog (Rana pipiens) in the Prairie Pothole Region”
适用场景
- 两栖动物种群遗传学研究：分析豹蛙种群结构、基因流模式及遗传分化水平
- 景观生态学研究：探究农业用地、地形等景观因子对物种遗传连通性的作用机制
- 生物保护规划：识别豹蛙扩散廊道，为栖息地保护与恢复优先级划分提供依据
- 湿地生态管理：评估草原坑洼区湿地碎片化对湿地依赖物种的影响
- 空间建模应用：验证Circuitscape等连通性模型在两栖动物栖息地研究中的适用性
