数据集概述
该数据集是为DADA2工具格式化的RDP真菌LSU分类训练数据（第11版），基于RDP分类器原始训练集和真菌未对齐序列处理生成，包含多种压缩与未压缩格式的训练文件，用于微生物分类学分析。
文件详解
该数据集包含6个文件，具体说明如下：
- 分类训练文件:
- RDP_LSU_fixed_train_set_v2.fa: 未压缩的FASTA格式分类训练文件
- RDP_LSU_fixed_train_set_v2.fa.gz: GZIP压缩的FASTA格式分类训练文件
- RDP_LSU_fixed_train_set_v2.fa.zip: ZIP压缩的FASTA格式分类训练文件
- 物种分配文件:
- rdp_species_assignment_LSU_v2.fa: 未压缩的FASTA格式物种分配文件
- rdp_species_assignment_LSU_v2.fa.gz: GZIP压缩的FASTA格式物种分配文件
- rdp_species_assignment_LSU_v2.fa.zip: ZIP压缩的FASTA格式物种分配文件
适用场景
- 微生物分类学研究: 用于DADA2工具进行真菌LSU序列的分类学注释
- 生物信息学分析: 支持基于高通量测序数据的微生物群落结构解析
- 真菌多样性研究: 辅助环境样本中真菌物种组成的鉴定与分析
- 生物信息学工具测试: 作为基准数据集验证分类算法的准确性
