数据集概述
本数据集为水稻根和地上部响应磷（Pi）饥饿及恢复过程的时空转录组分析数据，基于二代测序技术对9个时间点的126个RNA测序文库进行分析，涵盖磷剥夺早期、晚期及恢复阶段，识别差异表达基因、未注释基因座、可变剪接异构体及miRNA家族，揭示磷稳态调控机制。
文件详解
- 文件名称：tpc117325SupplementalDS1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充数据集1，具体内容未提供预览，推测包含转录组分析的基础数据或差异表达基因初步筛选结果
- 文件名称：tpc117325SupplementalDS2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充数据集2，具体内容未提供预览，推测包含差异表达基因的功能注释或通路分析结果
- 文件名称：tpc117325SupplementalDS3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充数据集3，具体内容未提供预览，推测包含未注释基因座或可变剪接异构体的相关信息
- 文件名称：tpc117325SupplementalDS4.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：补充数据集4，具体内容未提供预览，推测包含miRNA表达谱或磷稳态关键调控基因的验证数据
数据来源
论文“Spatio-temporal transcript profiling of rice roots and shoots in response to phosphate starvation and recovery”
适用场景
- 植物磷胁迫响应机制研究：分析水稻根和地上部在磷饥饿及恢复过程中的基因表达动态变化
- 磷稳态调控通路解析：基于差异表达基因分组结果，研究磷稳态相关的复杂信号通路
- 未注释基因功能挖掘：利用参考注释转录本组装结果，探索未注释差异表达基因座的功能
- 可变剪接调控分析：研究磷饥饿诱导的可变剪接异构体对基因表达及翻译活性的影响
- miRNA与磷胁迫关联研究：分析长期磷饥饿下miRNA表达谱，挖掘新的磷胁迫相关miRNA家族
- 作物磷高效利用分子育种：筛选磷胁迫响应关键基因，为水稻磷高效品种培育提供靶点
