数据集概述
本数据集为法国埃克兰国家公园15个高山峰顶(海拔2791–4102米)的植物群落研究数据,包含物种分布调查、系统发育分析相关文件,用于评估极端环境下环境过滤、历史及随机因素对植物群落结构的影响,支持高山植物共存机制的研究。
文件详解
- phy.Alpes.taxized.taxref.tre
- 文件格式:TRE
- 字段映射介绍:系统发育树文件,记录研究区域植物物种的系统发育关系,用于分析群落的系统发育结构
- Dryad1_EcrinsCommunityMatrix_27April2017April2017v3_edit.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含物种名称(species_name)、外来起源(Alien_origin)、特有性(Endemic)、分子序列数据(ITS、trnTLF、rbcL、matK、atpB)、区域分布(Regional)、所有峰顶分布(All Summits)、末次盛冰期分布(LGM)及11个具体峰顶的物种出现数据
- alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容介绍:压缩包,包含植物物种的分子序列比对文件,用于构建系统发育树
- genetrees.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容介绍:压缩包,包含植物物种的基因树文件,支持系统发育分析
数据来源
Dryad数据仓库(关联研究标题:Riders in the sky (islands): using a mega-phylogenetic approach to understand plant species distribution and coexistence at the altitudinal limits of angiosperm plant life)
适用场景
- 高山植物群落系统发育分析: 利用系统发育树和群落矩阵数据,研究极端环境下植物群落的系统发育聚类或发散模式
- 植物物种共存机制研究: 评估环境过滤、历史因素及中性过程对高山植物群落结构的相对影响
- 分子生态学分析: 通过基因序列比对和基因树文件,探究高山植物的进化关系与分布适应性
- 生物地理学研究: 结合物种分布数据与地理、气候变量,分析高山植物的地理分布格局及驱动因素
- 保护生物学应用: 基于特有性和分布数据,识别高山生态系统中的关键保护物种与区域