RNA二级结构序列分析数据集RNASecondaryStructureSequenceAnalysis-valentinasaldaeva
数据来源:互联网公开数据
标签:RNA序列, 二级结构, 生物信息学, 序列分析, 结构预测, 深度学习, 数据挖掘, 基因组学
数据概述:
该数据集包含来自公开数据库的RNA序列及其对应的二级结构信息。数据集旨在促进对RNA分子结构和功能的深入研究,尤其适用于生物信息学和计算生物学领域。主要特征如下:
时间跨度:数据未明确标注时间,可视为静态RNA序列数据集。
地理范围:数据来源不限,代表了多种生物体内的RNA序列。
数据维度:
id:序列的唯一标识符。
sequence:RNA序列,由A、U、G、C四种碱基组成。
structure:RNA二级结构,使用bpRNA字符串表示,描述了碱基之间的配对关系。
bpRNA_string:bpRNA字符串,用于描述RNA二级结构。
数据格式:CSV格式,文件名为new_sequences.csv,方便数据导入和分析。数据已进行标准化处理,便于后续的分析。
该数据集适用于RNA二级结构预测、RNA功能研究、以及生物信息学算法的开发和评估。
数据用途概述:
该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景:
研究与分析:适用于生物信息学和计算生物学领域的研究,例如RNA二级结构预测算法的开发和评估,RNA结构与功能关联性分析。
行业应用:为生物技术公司和制药企业提供数据支持,可用于药物设计、靶点识别等。
决策支持:支持生物信息学研究人员进行数据驱动的实验设计和结果分析。
教育和培训:作为生物信息学、计算生物学等相关课程的教学素材,帮助学生理解RNA结构与功能的关系,并进行相关的编程实践。
此数据集特别适合用于探索RNA序列与二级结构之间的关联,以及开发和验证RNA结构预测模型,从而加深对RNA分子行为的理解。