RNA二级结构预测数据集RNASecondaryStructurePredictionDataset-nyanpn

RNA二级结构预测数据集RNASecondaryStructurePredictionDataset-nyanpn

数据来源:互联网公开数据

标签:RNA结构, 生物信息学, 深度学习, 序列分析, 结构预测, 机器学习, 蛋白质折叠, 基因组学

数据概述: 该数据集包含来自EternaFold项目的数据,记录了RNA分子的二级结构预测结果。主要特征如下: 时间跨度:数据未标明具体时间,可视为静态数据集。 地理范围:数据来源未明确,但EternaFold项目是全球性的,数据具有广泛代表性。 数据维度:数据集包括RNA序列的ID、二级结构(结构字符串)和预测的loop类型(环类型)三个字段。其中,结构字符串使用括号表示碱基配对,点表示未配对碱基;loop类型则用字母表示不同的环类型。 数据格式:数据集主要包含两种文件格式:一个CSV文件(eternafold_mfe.csv)包含了结构化数据,以及大量.npy文件,可能包含了与结构预测相关的其他数据,如碱基配对概率等。

数据用途概述: 该数据集具有广泛的应用潜力,特别适用于以下场景: 研究与分析:适用于生物信息学、计算生物学等领域的学术研究,如RNA二级结构预测算法的开发与评估、RNA结构与功能的关联性分析等。 行业应用:可为生物制药、RNA治疗等行业提供数据支持,如RNA药物设计、RNA靶标识别等。 决策支持:支持生物信息学研究人员和生物技术公司进行RNA结构预测和分析,从而加速药物研发和生物技术创新。 教育和培训:可作为生物信息学、机器学习等相关课程的实训数据,帮助学生和研究人员深入理解RNA结构预测的原理和方法。 此数据集特别适合用于探索RNA二级结构的预测模型,评估不同算法的性能,以及研究RNA结构与功能之间的关系,并促进对RNA相关生物过程的理解。

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数据与资源

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版本 1.0
最后更新 五月 29, 2025, 23:59 (UTC)
创建于 五月 29, 2025, 23:59 (UTC)
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