数据集概述
本数据集为软体动物5S rDNA基因家族研究的补充数据，涵盖双壳类、腹足类和头足类等物种的5S rDNA序列分析结果，重点研究贻贝科物种的转录调控区保守性、二级结构预测及长期进化模式，识别出不同类型的非转录间隔区及假基因拷贝，支持软体动物5S rDNA基因家族的进化机制研究。
文件详解
- 文件名称：
README_for_Sequence alignments, clones analyzed and constraints applied.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：说明补充文件内容，包含Alpha、Beta、Delta等5S rDNA序列比对文件的描述
- 文件名称：
Sequence alignments, clones analyzed and constraints applied.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内含5S rDNA不同类型序列（如Alpha、Beta、Delta）的比对文件（FASTA格式），以及克隆分析和约束条件相关数据
- 文件名称：
Supplementary files.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内含研究相关的补充文件，可能包含序列比对结果、进化分析数据等辅助材料
数据来源
论文“The 5S rDNA gene family in mollusks: characterization of transcriptional regulatory regions, prediction of secondary structures, and long-term evolution, with special attention to Mytilidae mussels”
适用场景
- 软体动物基因进化研究：分析5S rDNA基因家族在双壳类、腹足类、头足类中的进化模式及祖先多态性
- 转录调控区保守性分析：研究不同软体动物类群5S rDNA上游区域TATA-like box等调控元件的保守性
- 贻贝科物种分子系统学研究：基于5S rDNA序列数据解析贻贝科物种间的系统发育关系
- 基因家族进化机制探讨：验证birth-and-death进化模型在软体动物5S rDNA基因家族中的适用性
- 假基因识别与功能分析：识别软体动物5S rDNA中的假基因拷贝，研究其形成与演化过程
