数据集概述
本数据集支持一项针对瑞士即食肉制品中抗生素耐药菌流行率与特征的研究。研究收集了瑞士肉铺的804份即食肉制品，分离出177株耐药菌（含148株多重耐药菌），涵盖ESBL、VRE等四类耐药菌。数据集包含表型耐药、耐药基因注释及耐药基因定位三类核心数据，为探究即食肉制品作为耐药菌潜在储存库提供支撑。
文件详解
- 文件名称: 1_Meat_isolates_Phenotype.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 内容说明: 包含表型耐药数据集，记录肉汤微量稀释法测得的最低抑菌浓度（MIC）值（肠杆菌科最多31种抗生素、肠球菌24种）、黏菌素耐药性滴度测试结果及多重耐药分类（如MDR指数）
- 文件名称: 2_Meat_isolates_Genotype.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 内容说明: 包含耐药基因与移动遗传元件注释数据集（AMRFinder Plus鉴定的耐药基因、MobileElementFinder鉴定的移动元件、MOB-suite质粒分型）、耐药基因定位数据集（SourceFinder分类的基因位置：质粒、染色体或噬菌体）
适用场景
- 食品安全研究: 分析即食肉制品中耐药菌的污染状况与公共卫生风险
- 耐药机制研究: 探究多重耐药菌的表型特征与耐药基因分布规律
- 微生物基因组学分析: 研究耐药基因的移动遗传元件携带情况及水平转移潜力
- 抗生素耐药性监测: 评估食品链中关键耐药菌（如ESBL、MRSA）的流行趋势
- 公共卫生政策制定: 为肉类食品安全监管及耐药菌防控策略提供数据支持
