数据集概述
本数据集为外生菌根真菌Russula属的全球多样化模式研究数据，包含系统发育树、基因序列比对文件、元数据等11个文件，涉及真菌进化关系、生物地理分布及宿主关联分析，用于验证温带与热带类群的分化差异及宿主切换对多样性的驱动作用。
文件详解
- 系统发育树文件（.tre格式，共5个）
- 文件名称：Russula multigene ML tree.tre、Russula mega-phylogeny ML constrained tree.tre、Russula multigene Bayesian tree.tre、Russulaceae BEAST tree.tre、Russula mega-phylogeny ultrametric tree.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：记录Russula属及相关类群的系统发育关系，包含分支结构、节点支持度等进化分析结果
- 基因序列比对文件（.nex/.nxs/.nexus格式，共3个）
- 文件名称：Russulaceae BEAST alignment.nex、Russula mega-phylogeny alignment.nxs、Russula multigene alignment.nexus
- 文件格式：NEX/NXS/NEXUS
- 字段映射介绍：包含真菌核糖体RNA等基因的序列比对数据，用于构建系统发育树
- 元数据文件（.txt格式，1个）
- 文件名称：GenBank_metadata.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：记录GenBank数据库中Russula菌株的基因信息，包含菌株编号、基因片段、登录号、作者及研究标题等
- 贝叶斯分析配置文件（.xml格式，1个）
- 文件名称：Russulaceae BEAUTi file.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：BEAST软件的分析配置文件，包含进化模型参数、采样设置等
- 压缩文件（.zip格式，1个）
- 文件名称：Clustertree 1.0.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含聚类树相关数据的压缩包
数据来源
论文“Into and out of the tropics: global diversification patterns in a hyper-diverse clade of ectomycorrhizal fungi”
适用场景
- 真菌系统发育研究：利用系统发育树文件分析Russula属的进化关系与分类地位
- 生物地理模式分析：通过多样化速率数据验证温带与热带真菌类群的分化差异
- 宿主关联进化研究：探究Russula与松科、被子植物等宿主植物的关联对多样性的驱动作用
- 进化模型验证：使用基因序列比对与贝叶斯分析文件测试不同进化模型的拟合效果
- 真菌多样性保护：基于全球多样化模式数据识别关键分布区域与保护优先级
