三级医院呼吸道与非呼吸道样本中耐碳青霉烯铜绿假单胞菌基因型与表型图谱数据集2025

数据集概述

本数据集包含三级医院呼吸道与非呼吸道样本中耐碳青霉烯铜绿假单胞菌的基因型与表型研究相关的可复现材料，包括分析脚本、基因流行度原始计数表及conda环境配置文件，支持研究结果的重复验证与扩展分析。

文件详解

• 分析脚本文件：
• reproduce_analysis_corrected.py：Python格式，用于复现研究中的统计分析（Fisher精确检验、BH-FDR校正）与图表生成
• 原始计数文件：
• table3_counts.csv：CSV格式，包含基因流行度计数数据
• table4_counts_corrected.csv：CSV格式，包含exoT/exoY基因与抗生素耐药性关联的计数数据
• 环境配置文件：
• environment.yml：YAML格式，conda环境配置文件，用于搭建一致的分析运行环境

适用场景

• 微生物耐药性研究：分析耐碳青霉烯铜绿假单胞菌的基因型与表型关联
• 抗菌药物耐药机制分析：探究exoT/exoY等基因与抗生素耐药性的关系
• 临床微生物学应用：为医院感染控制与抗菌药物管理提供数据支持
• 生物信息学方法验证：复现基于Fisher精确检验与BH-FDR校正的统计分析流程