数据集概述
本数据集是关于广泛分布的大型藻类马尾藻属(Sargassum)的历史生物地理学研究数据,包含系统发育、分类、序列来源、地理记录及分析输入文件,支持马尾藻属物种的起源、扩散路径及地理分布格局研究。
文件详解
- Sargassum_chronogram.tre
- 文件格式:TRE
- 内容说明:马尾藻属的时间树文件,记录物种的系统发育关系及分化时间。
- Species_taxonomy.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:马尾藻属物种分类信息表,包含物种分类层级、命名等数据。
- Sequence_sources.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:序列来源信息表,记录用于分析的基因序列的原始来源、获取方式等。
- Geographic_records.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 内容说明:地理记录信息表,包含马尾藻属物种的地理分布数据、采集地点等。
- BEAST_input.xml
- 文件格式:XML
- 内容说明:BEAST分析输入文件,用于系统发育与分化时间估算的参数设置及数据配置。
适用场景
- 马尾藻属系统发育研究: 利用时间树文件分析物种间的进化关系及分化时间。
- 生物地理学分析: 通过地理记录数据探究马尾藻属的起源中心、扩散路径及分布格局。
- 分类学研究: 基于物种分类信息表整理马尾藻属的分类体系,支持物种鉴定与命名规范。
- 分子进化分析: 结合序列来源数据开展基因序列的进化速率、选择压力等研究。
- 生物信息学分析: 使用BEAST输入文件复现或扩展马尾藻属的系统发育与分化时间分析。