数据集概述
本数据集围绕SARS-CoV-2刺突蛋白受体结合域(RBD)互作的上位性展开,包含野生型及Delta、Gamma、Omicron突变株的复合物构象数据,以及相关分析文件,为研究病毒突变对疫苗逃逸的影响提供数据支持。
文件详解
- 补充文档:
- SI_appendix.pdf: PDF格式,包含研究的补充附录内容
- gisaidAcknowledgements.dat、gisaidAcknowledgements.dat.gz: 数据格式分别为.dat及.gz压缩格式,记录GISAID数据库致谢信息
- 模型文件:
- exampleResfile_A403.dat: .dat格式,示例参数文件
- 复合物构象文件(.tgz压缩格式):
- wtReceptorEnsemble.tgz、wtAntibodyEnsemble.tgz: 野生型受体及抗体复合物构象集合
- deltaReceptorEnsemble.tgz、deltaAntibodyEnsemble.tgz: Delta突变株受体及抗体复合物构象集合
- gamma相关复合物构象文件(未在样本中显示具体名称)
- omicronReceptorEnsemble.tgz、omicronAntibodyEnsemble.tgz: Omicron突变株受体及抗体复合物构象集合
适用场景
- 病毒学研究: 分析SARS-CoV-2不同突变株RBD区域的结构特征
- 免疫学研究: 探究病毒突变对抗体中和作用的影响机制
- 疫苗研发: 评估病毒突变株的疫苗逃逸潜力
- 计算生物学: 基于复合物构象数据开展分子动力学模拟分析