数据集概述
本数据集包含支持Davis等2022年研究的全基因组SNP数据、形态学数据及生态学数据，用于分析西部 fence 蜥蜴（Sceloporus occidentalis）在华盛顿普吉特湾北部分布边缘的种群扩展、分化及存续动态。数据覆盖8个文件，含遗传数据、形态测量及生态信息，可复现该研究的种群遗传学分析。
文件详解
- 文档文件
- 文件名称：README_file.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含研究数据复现说明、作者信息及联系邮箱，说明数据集用于复现Davis等2022年发表于Scientific Reports的研究分析。
- 形态学数据文件
- 文件名称：SCOC_morphological_data.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：含个体id、性别（sex）、种群（population）、体长（svl）、头长（hl）、头宽（hw）、四肢长度（lfl/rfl等）、鳞片计数（ms/ds）等形态测量字段。
- 生态学数据文件
- 文件名称：SCOC_ecologyData.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：含采样日期（Date）、月份（Month）、采样地点（Locale）等生态信息字段。
- 遗传数据文件
- 文件名称：SCOC_0missing_1snpPerLocus.vcf、SCOC_0missing.vcf、SCOC_50missing_1snpPerLocus.vcf、SCOC_50missing.vcf
- 文件格式：VCF
- 字段映射介绍：全基因组SNP数据文件，包含不同缺失率（0%/50%）及单基因座单SNP过滤条件的遗传变异数据。
- 其他文件
- 文件名称：SCOC_snapp.xml
- 文件格式：XML
- 字段映射介绍：用于SNAPP（Species Tree Analysis Using SNPs）分析的XML元数据文件。
数据来源
Davis等2022年发表于Scientific Reports的研究：“Population expansion, divergence, and persistence in Western Fence Lizards (Sceloporus occidentalis) at their northern range edge”
适用场景
- 种群遗传学研究：分析西部 fence 蜥蜴边缘种群的遗传结构、分化程度及扩张历史。
- 形态生态学关联分析：探究形态特征（如体长、鳞片数）与种群遗传分化的相关性。
- 物种分布边缘动态研究：揭示冰川消退后物种在分布边缘的栖息地殖民化过程。
- 保护生物学应用：评估城市化对边缘种群存续的影响，为濒危栖息地保护提供数据支持。
