数据集概述
本数据集为加蓬林蛙(Scotobleps gabonicus)多样化机制评估研究的基因组数据,包含种群结构分析、 demographic模型选择及空间显式分析相关文件,用于探究西非下几内亚森林中该蛙类的异域和邻域分化模式,验证森林避难所、河流屏障等假说对生物多样性积累的作用。
文件详解
- 压缩文件包(共8个,格式均为ZIP)
- SNAPP_Files.zip:用于种群分化模型分析的SNAPP工具相关文件
- Arlequin.zip:群体遗传学分析工具Arlequin的输入输出文件
- BEAST.zip:分子演化分析工具BEAST的相关数据文件
- dadi.zip: demographic历史推断工具dadi的相关文件
- ddRADSeq.zip:双酶切RAD测序(ddRADSeq)的基因组数据文件
- EEMS.zip:空间基因流分析工具EEMS的相关文件
- Structure.zip:种群结构分析工具Structure的相关文件
- Admixture.zip:混合群体遗传结构分析工具Admixture的相关文件
数据来源
论文“Evaluating mechanisms of diversification in a Guineo-Congolian tropical forest frog using demographic model selection”
适用场景
- 热带森林生物多样性演化研究:分析加蓬林蛙种群分化与地理屏障、气候避难所的关系
- 基因组学模型验证:对比不同demographic模型对物种分化过程的解释力
- 种群遗传学分析:探究蛙类种群结构、基因流模式及遗传多样性分布
- 生物地理学假说检验:验证森林避难所、河流屏障等假说在物种分化中的作用
- 比较基因组学研究:为西非下几内亚森林其他物种的多样化机制研究提供参考框架