数据集概述
本数据集包含七种盐古菌(Haloferax和Haloarcula属)的基因组测序数据及相关分析文件。这些古菌因易培养、遗传工具成熟成为古菌生物学研究模型,其独特生理特性也为生物技术酶发现提供候选。数据覆盖度约20倍,组装平均50个contigs,可用于比较基因组学、功能基因富集及DNA代谢机制研究。
文件详解
- 文件名称:journal-2.pone.0041389.s013.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含盐古菌基因组相关的序列信息,预览内容显示为蛋白质序列(如Cenarchaeum symbiosum_A的氨基酸序列片段)
- 文件名称:Dataset_S3.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩归档文件,推测包含基因组测序或分析的补充数据
- 文件名称:Dataset_S1.cdt
- 文件格式:CDT
- 字段映射介绍:CDT格式文件,通常用于基因表达数据或比较基因组学的矩阵数据存储
数据来源
论文“Sequencing of seven haloarchaeal genomes reveals patterns of genomic flux”
适用场景
- 古菌基因组比较分析: 研究Haloferax和Haloarcula属间的基因功能组富集差异及基因组动态变化
- 古菌生物学机制研究: 分析DNA代谢相关基因(如TATA结合蛋白、增殖细胞核抗原)的复制与水平转移历史
- 生物技术酶资源挖掘: 基于盐古菌独特生理特性,筛选具有应用潜力的新型酶基因
- 微生物进化研究: 探究盐古菌基因组的结构特征及进化规律,为古菌分类与系统发育提供数据支持