数据集概述
本数据集围绕时标系统发育中隐藏种群结构的识别展开，包含相关的序列文件、系统发育数据文件、支持材料文档、算法代码及压缩包，为研究种群结构对谱系模式的影响、开发检测方法及应用于流行病学场景提供数据支持。
文件详解
- vb2017-genbank.fasta：FASTA格式文件，可能包含HIV-1部分pol序列的基因序列数据
- vb2017-genbank.nex：NEXUS格式文件，可能为HIV-1序列对应的系统发育数据文件
- supporting_material.pdf：PDF格式文件，包含研究的支持材料，可能涉及方法细节、结果补充等内容
- ot2.1.tar.gz：压缩包文件，可能包含研究中开发的算法或相关程序的源代码及资源
- ot2.1.datadryad.R：R语言格式文件，可能为用于数据处理或分析的R脚本代码
- ngono-gisp-align.nex.gz：压缩的NEXUS格式文件，可能包含淋病奈瑟菌全基因组序列的比对及系统发育数据
适用场景
- 分子流行病学研究：用于检测病原体系统发育树中的隐藏种群结构，识别暴发或快速传播事件
- 抗微生物耐药性研究：分析耐药突变相关的种群结构变化，探究耐药基因型的扩张规律
- 进化生物学分析：研究种群结构对谱系模式的影响，量化实际与理论谱系的差异
- 计算生物学方法开发：基于数据验证和优化种群结构检测的统计测试及算法
