数据10X_Genomics_EBAII_n1_Based_人类PBMC单细胞转录组MEX矩阵完整数据

数据集概述

该数据集为10X Genomics提供的公开单细胞RNA测序（scRNAseq）数据，包含约一万个人类供体的外周血单个核细胞（PBMC），使用3'捕获试剂盒v3实验、Cell Ranger v3分析，基于GRCh38-2020-A参考基因组映射，采用MEX稀疏矩阵格式，列数缩减至原五分之一。

文件详解

• matrix.mtx.gz：压缩格式的Market Exchange Format（MEX）稀疏矩阵文件，存储基因表达量数据
• features.tsv.gz：压缩格式的特征文件，包含基因或转录本的相关信息
• barcodes.tsv.gz：压缩格式的条形码文件，对应细胞的唯一标识符
• pbmc_10k_v3_summary.html：HTML格式的实验总结报告，提供数据集的基本统计和分析概述

数据来源

10X Genomics

适用场景

• 单细胞转录组数据分析教学：适合学习scRNAseq数据的基础处理流程
• 生物信息学方法验证：用于测试或比较单细胞数据分析算法的性能
• 基因表达模式研究：探索PBMC细胞群体的基因表达特征
• 生物信息学工具评估：验证基于MEX格式的scRNAseq数据处理工具的兼容性