数据集概述
本数据集围绕南美啮齿动物亚科Sigmodontinae的适应性辐射展开，研究生物地理在物种形成中的作用。通过重建时间校准的系统发育树、分析14个区域的历史生物地理变迁及区域转换率，探讨地理多样化对适应性辐射的影响，为理解哺乳动物适应性辐射过程提供数据支持。
文件详解
- 系统发育树输出文件：
Schenk&Steppan.Beast_Output.tre，格式为.tre，包含基于4个核基因和1个线粒体基因重建的时间校准系统发育树结果。
- 系统发育分析输入文件：
Schenk&Steppan.Beast_Input.xml，格式为.xml，为Beast软件的输入配置文件，用于生成时间校准的系统发育树。
- 系统发育数据文件：
700.Sigmo.BI.nex，格式为.nex，包含77% Sigmodontinae多样性的基因序列数据，用于系统发育重建。
- 滑动窗口分析代码文件：
SlidingWindow.R，格式为.r，用于实现区域转换率的滑动窗口估计方法。
- 滑动窗口模拟代码文件：
SlidingWindowSimulations.R，格式为.r，用于进行区域转换率的滑动窗口模拟分析。
数据来源
论文“The role of geography in adaptive radiation”
适用场景
- 生物地理学研究：分析南美啮齿动物亚科Sigmodontinae的地理分布与物种形成的关系。
- 适应性辐射机制研究：探讨地理多样化在哺乳动物适应性辐射过程中的作用。
- 系统发育分析：利用时间校准的系统发育树数据，研究物种的演化历史和分化时间。
- 生物信息学方法应用：通过滑动窗口分析代码，开展区域转换率的动态变化研究。
