数据集概述
该数据集包含2016年美国阿拉斯加基奈半岛斯利科克溪流域生物资源调查中扫网样本的宏基因组原始数据,含125个样本的高通量测序FASTQ文件及采集数据,用于分析流域内节肢动物等生物多样性。
文件详解
- ArctosData_43C6167EB1.csv:CSV格式,包含样本采集数据,字段示例有SCIENTIFIC_NAME(物种学名)、COLLECTORS(采集者)、SPEC_LOCALITY(采样地点)等
- FASTQ.zip:ZIP压缩包,包含所有样本的Illumina MiSeq测序原始FASTQ文件
- Bowser 4869.pdf:PDF格式,RTL Genomics提供的样本提取方法文档
- Illumina MiSeq Two-Step Method 454 profile only.docx:DOCX格式,Illumina MiSeq测序方法文档
- Bowser_4869M.txt:TXT格式,包含样本ID、引物序列等信息,如mlCOIlintF/HCO2198引物序列
适用场景
- 生物多样性研究:分析阿拉斯加斯利科克溪流域节肢动物群落组成与分布
- 宏基因组学分析:基于COI基因序列数据进行物种鉴定与分类
- 流域生态监测:评估流域生态系统中生物群落对环境的响应
- 分子生态学研究:探索极端环境下生物适应性与进化机制